RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.2■□□□□ 0.82
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SRSF1-201ENST00000258962 FIBPO43427 364 aa20.2■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 GH2P01242 217 aa20.2■□□□□ 0.82
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SRSF1-201ENST00000258962 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.2■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.2■□□□□ 0.82
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SRSF1-201ENST00000258962 GPT2Q8TD30 523 aa20.2■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 CEP95Q96GE4 821 aa20.2■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 CFHR5Q9BXR6 569 aa20.2■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
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SRSF1-201ENST00000258962 KRT85P78386 507 aa20.19■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.19■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.19■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 MAP3K14Q99558 947 aa20.19■□□□□ 0.82
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SRSF1-201ENST00000258962 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 DEXIO95424 95 aa20.18■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 JAG1P78504 1218 aa20.18■□□□□ 0.82
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SRSF1-201ENST00000258962 KRT40Q6A162 431 aa20.18■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.18■□□□□ 0.82
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SRSF1-201ENST00000258962 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 CRHR2Q13324 411 aa20.17■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 KIF28PB7ZC32 967 aa20.17■□□□□ 0.82
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SRSF1-201ENST00000258962 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
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SRSF1-201ENST00000258962 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 CCDC17Q96LX7 622 aa20.17■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.17■□□□□ 0.82
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SRSF1-201ENST00000258962 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 KIF5BP33176 963 aa20.16■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 MOGSQ13724 837 aa20.16■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 GSE1Q14687 1217 aa20.16■□□□□ 0.82
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SRSF1-201ENST00000258962 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.16■□□□□ 0.82
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SRSF1-201ENST00000258962 USP17L10C9JJH3 530 aa20.15■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 HMGCS2P54868 508 aa20.15■□□□□ 0.82
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SRSF1-201ENST00000258962 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa20.14■□□□□ 0.82
SRSF1-201ENST00000258962 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.14■□□□□ 0.81
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SRSF1-201ENST00000258962 BACE1P56817 501 aa20.14■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 MTMR2Q13614 643 aa20.14■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 TRIM29Q14134 588 aa20.14■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.14■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.14■□□□□ 0.81
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SRSF1-201ENST00000258962 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
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SRSF1-201ENST00000258962 SLC35G1Q2M3R5 365 aa20.13■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.13■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 BRAPQ7Z569 592 aa20.13■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.13■□□□□ 0.81
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SRSF1-201ENST00000258962 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
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SRSF1-201ENST00000258962 USP28Q96RU2 1077 aa20.12■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.12■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 MTMR7Q9Y216 660 aa20.12■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.12■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 TTLL1O95922 423 aa20.12■□□□□ 0.81
SRSF1-201ENST00000258962 UBE2HP62256 183 aa20.12■□□□□ 0.81
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