RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 C6orf50Q9HD87 102 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD9-201ENST00000249499 IMPACTQ9P2X3 320 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD9-201ENST00000249499 MORC3Q14149 939 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD9-201ENST00000249499 C4orf32Q8N8J7 132 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD9-201ENST00000249499 EPSTI1Q96J88 318 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD9-201ENST00000249499 VWA3AA6NCI4 1184 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD9-201ENST00000249499 MCM7P33993 719 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD9-201ENST00000249499 PTGER2P43116 358 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD9-201ENST00000249499 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
HOXD9-201ENST00000249499 SLC16A10Q8TF71 515 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD9-201ENST00000249499 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD9-201ENST00000249499 FOXN1O15353 648 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD9-201ENST00000249499 CHRNA5P30532 468 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD9-201ENST00000249499 NAPAP54920 295 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD9-201ENST00000249499 PDILTQ8N807 584 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD9-201ENST00000249499 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
HOXD9-201ENST00000249499 SGIP1Q9BQI5 828 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD9-201ENST00000249499 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
HOXD9-201ENST00000249499 USP17L5A8MUK1 530 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD9-201ENST00000249499 IQUBQ8NA54 791 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD9-201ENST00000249499 DHX58Q96C10 678 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD9-201ENST00000249499 MTMR7Q9Y216 660 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD9-201ENST00000249499 ADAMTS3O15072 1205 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 PRPHP41219 470 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 GSDMDP57764 484 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 SOGA3Q5TF21 947 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 KIAA0825Q8IV33 1275 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 SPON1Q9HCB6 807 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 A0A087X0B3 334 aa26■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 PRR29P0C7W0 189 aa26■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 NFIAQ12857 509 aa26■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 PAGE5Q96GU1 130 aa26■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 GSDMAQ96QA5 445 aa26■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 KCNQ5Q9NR82 932 aa26■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 NRBP1Q9UHY1 535 aa26■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 SCN9AQ15858 1988 aa26■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 BMP6P22004 513 aa26■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 TXLNAP40222 546 aa26■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 ISM2Q6H9L7 571 aa26■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 PPP1R18Q6NYC8 613 aa26■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 PI4KBQ9UBF8 816 aa26■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 SMCO2A6NFE2 343 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 CBFA2T2O43439 604 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 E2F4Q16254 413 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 HSD3B7Q9H2F3 369 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF543Q08ER8 600 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 CCDC144BQ3MJ40 725 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 RASGRP4Q8TDF6 673 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 PIGSQ96S52 555 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 PYCARDQ9ULZ3 195 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 IL17AQ16552 155 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 AOC3Q16853 763 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 FANCCQ00597 558 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 DPYDQ12882 1025 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 DTHD1Q6ZMT9 781 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 RASGRP2Q7LDG7 609 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 HOMER1Q86YM7 354 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 LRRC8AQ8IWT6 810 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 IFNKQ9P0W0 207 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 ENTPD3O75355 529 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 INF2Q27J81 1249 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 MKL1Q969V6 931 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 FAM198AQ9UFP1 575 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 AK8Q96MA6 479 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 CPVLQ9H3G5 476 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 NYAP2Q9P242 653 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD9-201ENST00000249499 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXD9-201ENST00000249499 PSMD1Q99460 953 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXD9-201ENST00000249499 SIPA1L1O43166 1804 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXD9-201ENST00000249499 PSME4Q14997 1843 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD9-201ENST00000249499 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD9-201ENST00000249499 PPIP5K2O43314 1243 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD9-201ENST00000249499 SEMA3FQ13275 785 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD9-201ENST00000249499 TATDN1Q6P1N9 297 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD9-201ENST00000249499 PDXDC2PQ6P474 469 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD9-201ENST00000249499 NEK8Q86SG6 692 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD9-201ENST00000249499 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXD9-201ENST00000249499 CCSER1Q9C0I3 900 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD9-201ENST00000249499 UBA5Q9GZZ9 404 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD9-201ENST00000249499 VPS33BQ9H267 617 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD9-201ENST00000249499 DNAJC18Q9H819 358 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD9-201ENST00000249499 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD9-201ENST00000249499 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXD9-201ENST00000249499 CCDC93Q567U6 631 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD9-201ENST00000249499 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD9-201ENST00000249499 TTLL6Q8N841 843 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD9-201ENST00000249499 VAT1LQ9HCJ6 419 aa25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms