RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243056.4

HOXC13-201, Transcript of homeobox C13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC13, Length 2,423 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13-201ENST00000243056 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
HOXC13-201ENST00000243056 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
HOXC13-201ENST00000243056 ZNF202O95125 648 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC13-201ENST00000243056 MECOMQ03112 1051 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC13-201ENST00000243056 MTF1Q14872 753 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC13-201ENST00000243056 FAM76AQ8TAV0 307 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC13-201ENST00000243056 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC13-201ENST00000243056 ITFG2Q969R8 447 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC13-201ENST00000243056 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC13-201ENST00000243056 ETAA1Q9NY74 926 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC13-201ENST00000243056 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
HOXC13-201ENST00000243056 NDUFA8P51970 172 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC13-201ENST00000243056 ADCY2Q08462 1091 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC13-201ENST00000243056 UBE3CQ15386 1083 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC13-201ENST00000243056 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC13-201ENST00000243056 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
HOXC13-201ENST00000243056 AIDAQ96BJ3 306 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC13-201ENST00000243056 CBFA2T2O43439 604 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 FGAP02671 866 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 GGCXP38435 758 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 LZTFL1Q9NQ48 299 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 FANCLQ9NW38 375 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 IKBKBO14920 756 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 STX10O60499 249 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 STYK1Q6J9G0 422 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 TC2NQ8N9U0 490 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 INCENPQ9NQS7 918 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 KLC4Q9NSK0 619 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 RPS6KB1P23443 525 aa22.31■■□□□ 1.16
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HOXC13-201ENST00000243056 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 ANKRD1Q15327 319 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 GTF2IP78347 998 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 WDR93Q6P2C0 686 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 PDILTQ8N807 584 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 MTFR1LQ9H019 292 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 AP1ARQ63HQ0 302 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 TICAM2Q86XR7 235 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 PLCD4Q9BRC7 762 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 CAPS2Q9BXY5 557 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 F8W031 263 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
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HOXC13-201ENST00000243056 PSMA5P28066 241 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 GNGT1P63211 74 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 CHST3Q7LGC8 479 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 HOMEZQ8IX15 550 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 PPFIA1Q13136 1202 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 CNKSR1Q969H4 720 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 MYH7P12883 1935 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 CTAGE15A4D2H0 777 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 PFKFB2O60825 505 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 CTAGE8P0CG41 777 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 EVX2Q03828 476 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 CTAGE6Q86UF2 777 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 CTAGE4Q8IX94 777 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 CHD4Q14839 1912 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 GOLGA6CA6NDK9 693 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 GOLGA6DP0CG33 693 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 AOC3Q16853 763 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 CEP85LQ5SZL2 805 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 STIM1Q13586 685 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 TLDC1Q6P9B6 456 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 RASSF9O75901 435 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 KIAA0754O94854 1291 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 TUBB4BP68371 445 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 TTLL6Q8N841 843 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXC13-201ENST00000243056 A0A1B0GUA9 196 aa22.27■■□□□ 1.16
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