RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 PTPREP23469 700 aa26.14■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 HSPA4P34932 840 aa26.14■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 PLS1Q14651 629 aa26.14■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 ADCK5Q3MIX3 580 aa26.14■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 RAET1EQ8TD07 263 aa26.14■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 PRR12Q9ULL5 1215 aa26.14■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 RIPK3Q9Y572 518 aa26.14■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 ZNF536O15090 1300 aa26.14■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 SLC16A2P36021 539 aa26.14■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 CCDC96Q2M329 555 aa26.14■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 RNF20Q5VTR2 975 aa26.14■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 SH3TC2Q8TF17 1288 aa26.14■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 USP26Q9BXU7 913 aa26.14■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 GPCPD1Q9NPB8 672 aa26.14■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 BRCA2P51587 3418 aa26.13■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 ZBED4O75132 1171 aa26.13■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 REC8O95072 547 aa26.13■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 GRB14Q14449 540 aa26.13■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 PXYLP1Q8TE99 480 aa26.13■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 ZNF333Q96JL9 665 aa26.13■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 NUDT12Q9BQG2 462 aa26.13■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 SMCHD1A6NHR9 2005 aa26.12■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 SLC15A5A6NIM6 579 aa26.12■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 ADCY3O60266 1144 aa26.12■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A27O95847 323 aa26.12■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA8HP0CJ92 632 aa26.12■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 FDX1P10109 184 aa26.12■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 GRK4P32298 578 aa26.12■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 SNAP25P60880 206 aa26.12■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa26.12■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 MTA3Q9BTC8 594 aa26.12■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 MROH8Q9H579 483 aa26.12■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 LY9Q9HBG7 655 aa26.12■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 CCDC85CA6NKD9 419 aa26.11■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 PRC1O43663 620 aa26.11■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 ELNP15502 786 aa26.11■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 CYP2B6P20813 491 aa26.11■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 MCM5P33992 734 aa26.11■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 WDR78Q5VTH9 848 aa26.11■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 NCAPG2Q86XI2 1143 aa26.11■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 CPXCR1Q8N123 301 aa26.11■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 SOCS4Q8WXH5 440 aa26.11■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 NEK1Q96PY6 1258 aa26.11■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 TEX13BQ9BXU2 312 aa26.11■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 SNX14Q9Y5W7 946 aa26.11■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 OAZ1P54368 228 aa26.1■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 IKQ13123 557 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 MAP2K5Q13163 448 aa26.1■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 WTAPQ15007 396 aa26.1■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 TMEM67Q5HYA8 995 aa26.1■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 IFFO2Q5TF58 517 aa26.1■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 SYDE2Q5VT97 1194 aa26.1■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 SLAIN1Q8ND83 568 aa26.1■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 CPVLQ9H3G5 476 aa26.1■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 STRNO43815 780 aa26.09■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 TROAPQ12815 778 aa26.09■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 STAG2Q8N3U4 1231 aa26.09■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 AGBL1Q96MI9 1066 aa26.09■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 UBA5Q9GZZ9 404 aa26.09■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 COBLO75128 1261 aa26.08■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 IGHA2P01877 340 aa26.08■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 HOXC6P09630 235 aa26.08■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 ABRAQ8N0Z2 381 aa26.08■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 NPLOC4Q8TAT6 608 aa26.08■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 TMEM87BQ96K49 555 aa26.08■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 LRRC2Q9BYS8 371 aa26.08■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 MAD2L2Q9UI95 211 aa26.08■■□□□ 1.77
SYF2-201ENST00000236273 ZNF236Q9UL36 1845 aa26.07■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 ERICH2A1L162 156 aa26.07■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 ADORA2AP29274 412 aa26.07■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 SART3Q15020 963 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 CCL14Q16627 93 aa26.07■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP26.07■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 NBPF11Q86T75 865 aa26.07■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 TRIB2Q92519 343 aa26.07■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa26.07■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 RGS2P41220 211 aa26.06■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 LIFRP42702 1097 aa26.06■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 TRIM32Q13049 653 aa26.06■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 KRT32Q14532 448 aa26.06■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 MTFR1Q15390 333 aa26.06■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 SLC35G1Q2M3R5 365 aa26.06■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 ASPRV1Q53RT3 343 aa26.06■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 CCDC174Q6PII3 467 aa26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms