RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216420.11

CGRRF1-201, Transcript of cell growth regulator with ring finger domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CGRRF1, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1-201ENST00000216420 JADE2Q9NQC1 790 aa20.58■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 ARHGAP23Q9P227 1491 aa20.58■□□□□ 0.89
CGRRF1-201ENST00000216420 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 EYA2O00167 538 aa20.58■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 GPAA1O43292 621 aa20.58■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.58■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 P3H4Q92791 437 aa20.58■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 FERMT2Q96AC1 680 aa20.58■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF233A6NK53 670 aa20.57■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 H7C1D1 291 aa20.57■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 BMP15O95972 392 aa20.57■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 TCP1P17987 556 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 ATP1A2P50993 1020 aa20.57■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 VAV2P52735 878 aa20.57■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 GUCY1A3Q02108 690 aa20.57■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 SH2D3CQ8N5H7 860 aa20.57■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 SENP2Q9HC62 589 aa20.57■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 H7C1W4 665 aa20.57■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 PAX7P23759 505 aa20.57■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 IFT88Q13099 833 aa20.57■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.57■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC121Q6ZUS5 278 aa20.57■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 RETREG2Q8NC44 543 aa20.57■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa20.57■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 TTYH3Q9C0H2 523 aa20.57■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 PKD1L3Q7Z443 1732 aa20.56■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 MYL6BP14649 208 aa20.56■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 GRIK3Q13003 919 aa20.56■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 CFAP58Q5T655 872 aa20.56■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.56■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.56■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC114Q96M63 670 aa20.56■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 GDF3Q9NR23 364 aa20.56■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 TFR2Q9UP52 801 aa20.56■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 NEBLO76041 1014 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 XRCC4Q13426 336 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 NELFBQ8WX92 580 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 EPSTI1Q96J88 318 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 NUP58Q9BVL2 599 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 TACC1O75410 805 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 CASP1P29466 404 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 KIF5AQ12840 1032 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF790Q6PG37 636 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 TRIM22Q8IYM9 498 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 CYFIP2Q96F07 1278 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 XDHP47989 1333 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 TJP1Q07157 1748 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 TNRQ92752 1358 aa20.55■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 TRIM75PA6NK02 468 aa20.54■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 DEXIO95424 95 aa20.54■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 KRT14P02533 472 aa20.54■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 GUCY1A2P33402 732 aa20.54■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.54■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 IFT20Q8IY31 132 aa20.54■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 C5orf60A6NFR6 353 aa20.54■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 MGRN1O60291 552 aa20.54■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa20.54■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.54■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.54■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 BATF3Q9NR55 127 aa20.54■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 RMND1Q9NWS8 449 aa20.54■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 CHD4Q14839 1912 aa20.53■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 PDHBP11177 359 aa20.53■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 RCAN1P53805 252 aa20.53■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 PAK2Q13177 524 aa20.53■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 NR5A1Q13285 461 aa20.53■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 TMEM67Q5HYA8 995 aa20.53■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 KCTD16Q68DU8 428 aa20.53■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 HOOK2Q96ED9 719 aa20.53■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.53■□□□□ 0.88
CGRRF1-201ENST00000216420 TIAM2Q8IVF5 1701 aa20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms