RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001172.11

Ankrd39-201, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd39, Length 2,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Krt39Q6IFX4 482 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tjap1Q9DCD5 539 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gm7356A0A087WSA6 508 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Rsph10bE9PYQ0 876 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Rasa2P58069 847 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Zdhhc14Q8BQQ1 489 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Galntl5Q9D4M9 431 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cyp2j7A0A140T8U1 504 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cul4bA2A432 970 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 GabreA2AMW3 916 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tpm2P58774 284 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tigd5Q499M4 642 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Anks1bQ8BIZ1 1259 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tomm22Q9CPQ3 142 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Nlrp5Q9R1M5 1163 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Anks1aP59672 1150 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Kctd1Q5M956 257 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Brip1Q5SXJ3 1174 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 PaoxQ8C0L6 504 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Itgb4A2A863 1818 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Col2a1P28481 1487 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ccdc6D3YZP9 469 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Krt78E9Q0F0 1068 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Mybl2P48972 704 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gse1Q3U3C9 1213 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Psg29Q3URN6 468 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tbc1d9bQ5SVR0 1263 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cnga2Q62398 664 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gpbp1Q6NXH3 473 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Klhl30Q8C3F7 581 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Fermt2Q8CIB5 680 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Styxl1Q9DAR2 321 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Nr1i2O54915 431 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Adssl1P28650 457 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Adck2Q6NSR3 617 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Fbxo18Q8K2I9 1042 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Kctd10Q922M3 315 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Arl6ip4Q9JM93 229 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ugt1a6bK9J7B2 531 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cdc37Q61081 379 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ezh2Q61188 746 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ugt1a6Q64435 531 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ugt1a7cQ6ZQM8 531 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 AdpgkQ8VDL4 496 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cd248Q91V98 765 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Q91WD4 421 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tab2Q99K90 693 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Pex3Q9QXY9 372 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Slc27a3O88561 667 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Mx1P09922 631 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 GlyctkQ8QZY2 523 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tmem191cQ9JJB1 302 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Copb2O55029 905 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Sept2P42208 361 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Oxr1Q4KMM3 866 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Eme2Q56A04 373 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 RragbQ6NTA4 374 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Sval3Q76I99 144 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Aggf1Q7TN31 711 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ccdc172Q810N9 267 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Glrx3Q9CQM9 337 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Snrnp35Q9D384 244 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 SmapQ9R0P4 181 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Col1a1P11087 1453 aa20.22■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cdkn1cP49919 348 aa20.22■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Mtss1lQ6P9S0 715 aa20.22■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Trub2Q91WG3 331 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cfap70D3YVL2 1141 aa20.21■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 CnpP16330 420 aa20.21■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Eif5P59325 429 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ccna1Q61456 421 aa20.21■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Abcf1Q6P542 837 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gpcpd1Q8C0L9 675 aa20.21■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Arhgef6Q8K4I3 771 aa20.21■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Taf6lQ8R2K4 616 aa20.21■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Armc3A2AU72 881 aa20.21■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Qrich1Q3UA37 777 aa20.21■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gxylt1Q3UHH8 404 aa20.21■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Kcnj11Q61743 390 aa20.21■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Rbm12b2Q66JV4 834 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cep135Q6P5D4 1140 aa20.21■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 PigsQ6PD26 555 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Armc6Q8BNU0 468 aa20.21■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tesk2Q8VCT9 570 aa20.21■□□□□ 0.83
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Vmn2r71L7N2D8 855 aa20.2■□□□□ 0.82
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ncf1Q09014 390 aa20.2■□□□□ 0.82
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Pla2g4eQ50L42 875 aa20.2■□□□□ 0.82
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Akap4Q60662 849 aa20.2■□□□□ 0.82
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ift88Q61371 824 aa20.2■□□□□ 0.82
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Scfd1Q8BRF7 639 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ildr1Q8CBR1 537 aa20.2■□□□□ 0.82
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cabp7Q91ZM8 215 aa20.2■□□□□ 0.82
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Borcs6Q9D6W8 360 aa20.2■□□□□ 0.82
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cd274Q9EP73 290 aa20.2■□□□□ 0.82
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Myh14Q6URW6 2000 aa20.2■□□□□ 0.82
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Herc3A6H6S0 1050 aa20.2■□□□□ 0.82
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Znf568E9PYI1 671 aa20.2■□□□□ 0.82
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Pdia4P08003 638 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.9 ms