RNA–Protein interactions for RNA: YNL233W

BNI4, Transcript of Targeting subunit for Glc7p protein phosphatase, yeast

Gene BNI4, Length 2,679 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BNI4	YNL233W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YEL043W	P32618	956 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	SEF1	P34228	1148 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	MRPL7	P36519	292 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	MPS3	P47069	682 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	MSE1	P48525	536 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	SNF12	P53628	566 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	RIA1	P53893	1110 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YAT1	P80235	687 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.1	□□□□□ -1.91	not detected
BNI4	YNL233W	MMR1	Q06324	491 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	IZH3	Q07959	543 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YDR215C	Q12240	137 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	TAF2	P23255	1407 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	CDC6	P09119	513 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	KAR4	P25583	335 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	KAE1	P36132	386 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	RRT2	P38332	387 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	ICP55	P40051	511 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	INP52	P50942	1183 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	SPC98	P53540	846 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	MGR3	Q04472	501 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	DON1	Q05610	365 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	CRN1	Q06440	651 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	DCI1	Q08558	271 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YDL176W	Q12027	708 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	TPK2	P06245	380 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	APN1	P22936	367 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	BUD14	P27637	709 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	MRE11	P32829	692 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	NIP100	P33420	868 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	LOT5	P34234	306 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	MUP3	P38734	546 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	ALG5	P40350	334 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	IRC8	P47046	822 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YGR130C	P53278	816 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	RSM28	Q03430	361 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	SPH1	Q06160	661 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	THI72	Q08579	599 aa		3.09	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YOR093C	Q12275	1648 aa		3.09	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	HAP1	P0CE41	1502 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	RIB7	P33312	244 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	SEC66	P33754	206 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	HCS1	P34243	683 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	CTP1	P38152	299 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	WSS1	P38838	269 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	MTG2	P38860	518 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	FET5	P43561	622 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	FHN1	P53279	174 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	YNR068C	P53754	272 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	MFM1	Q02783	413 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	FIN1	Q03898	291 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	ARG7	Q04728	441 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	BAG7	Q12128	409 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	PSY3	Q12318	242 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	SEC39	Q12745	709 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	CYC7	P00045	113 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	MET3	P08536	511 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	ADH7	P25377	361 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	DAL80	P26343	269 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	SIP1	P32578	815 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	PLB1	P39105	664 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	NAS2	P40555	220 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	UBX6	P47049	396 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	MUP1	P50276	574 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	YNL144C	P53907	740 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	DUS4	Q06063	367 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.08	□□□□□ -1.92	not detected
BNI4	YNL233W	RLM1	Q12224	676 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	MDY2	Q12285	212 aa		3.08	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	TRM3	Q07527	1436 aa		3.07	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	CDC5	P32562	705 aa		3.07	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	YME2	P32843	850 aa		3.07	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
BNI4	YNL233W	SLM4	P38247	162 aa		3.07	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13 ms