RNA–Protein interactions for RNA: YLR073C

RFU1, Transcript of Protein that inhibits Doa4p deubiquitinating activity, yeast

Gene RFU1, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RFU1	YLR073C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
RFU1	YLR073C	SIR1	P21691	654 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	CLB1	P24868	471 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	CLB4	P24871	460 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	DMC1	P25453	334 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	PEP3	P27801	918 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YEL043W	P32618	956 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	SUR1	P33300	382 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	KDX1	P36005	433 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	OAF3	P36023	863 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	STB6	P36085	766 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	DAD2	P36162	133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	HMT1	P38074	348 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	PUG1	P40100	303 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	LTP1	P40347	161 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	PRM2	P40534	656 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	MET12	P46151	657 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	CUL3	P53202	744 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	SLG1	P54867	378 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	NKP2	Q06162	153 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YPQ2	Q06328	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	TRM8	Q12009	286 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	RAD50	P12753	1312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	SAC7	P17121	654 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	REC104	P33323	182 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	EMC3	P36039	253 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YKL077W	P36081	392 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	KAE1	P36132	386 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	PCH2	P38126	564 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	DUN1	P39009	513 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	GIP4	P39732	760 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YER186C	P40101	306 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	SPO22	P40511	975 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	PCI8	P40512	444 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	ALT1	P52893	592 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	SNF12	P53628	566 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	DSE4	P53753	1117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	VPS75	P53853	264 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	TOF2	Q02208	771 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	SNO4	Q04902	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	DON1	Q05610	365 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	HSP32	Q08992	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	TGL5	Q12043	749 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	RCN2	Q12044	265 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	APC2	Q12440	853 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	GAL7	P08431	366 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YCR015C	P25616	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	SEC65	P29478	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	DUG2	P38149	878 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	ALG14	P38242	237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	VID24	P38263	362 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YHL017W	P38745	532 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	TCD1	P38756	429 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	ERC1	P38767	581 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	HXT7	P39004	570 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	SWD1	P39706	426 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YJR061W	P40355	935 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	PKP1	P40530	394 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	INA22	P40576	216 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	STU2	P46675	888 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	DSL1	P53847	754 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YNL146W	P53906	100 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YAP6	Q03935	383 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	CSM3	Q04659	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	GGA1	Q06336	557 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	ARR1	Q06596	294 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	GNT1	Q12096	491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RFU1	YLR073C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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