RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	INP53	Q12271	1107 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	SPE4	Q12455	300 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	STE50	P25344	346 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	YCR006C	P25350	157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	POL4	P25615	582 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	COQ3	P27680	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	YBL029W	P38201	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	MRX6	P48564	524 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	LCL3	P53153	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	PIG1	Q06216	648 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	YPT53	P36019	220 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	YBR225W	P38321	900 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	FLC2	P39719	783 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	SNO3	P43544	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	YTP1	P53584	459 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	SEG1	Q04279	960 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	MFB1	Q04922	465 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	NMD4	Q12129	218 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	RAP1	P11938	827 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	VPS41	P38959	992 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	CCT6	P39079	546 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	BUR6	P40096	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	VPS75	P53853	264 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	ZDS2	P54786	942 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	RTT109	Q07794	436 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	RTP1	Q12751	981 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	AGP2	P38090	596 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	UIP3	P39547	235 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	NPR2	P39923	615 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	DIA3	P52290	468 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	ASI1	P54074	624 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	FRE3	Q08905	711 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	CTI6	Q08923	506 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	CRC1	Q12289	327 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	MRP7	P12687	371 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	CNA1	P23287	553 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	VMA16	P23968	213 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	CLB2	P24869	491 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	YIH1	P25637	258 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	GLO1	P50107	326 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	NNF2	P53253	936 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	MAK10	Q02197	733 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	ARP9	Q05123	467 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	RRI1	Q12468	440 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPC17	YJL011C	INH1	P01097	85 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	GCN4	P03069	281 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	ADH7	P25377	361 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	SRO77	P38163	1010 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	XBP1	P40489	647 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	YIL024C	P40543	189 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	IRC6	P43615	237 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	RCN2	Q12044	265 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	CBS1	P14066	229 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	SYN8	P31377	255 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	ARP1	P38696	384 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	ELO1	P39540	310 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	RGI2	P40188	164 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	SWF1	Q04629	336 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	BUD7	Q08754	746 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	ARG3	P05150	338 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	PGS1	P25578	521 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	YKL050C	P35736	922 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	LTP1	P40347	161 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	CFD1	P40558	293 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.5	□□□□□ -1.69	not detected
RPC17	YJL011C	MAF1	P41910	395 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RPC17	YJL011C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69

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