RNA–Protein interactions for RNA: YGR033C

TIM21, Transcript of Nonessential component of the TIM23 complex, yeast

Gene TIM21, Length 720 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TIM21	YGR033C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIM21	YGR033C	SEF1	P34228	1148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM21	YGR033C	MNN2	P38069	597 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM21	YGR033C	CST26	P38226	397 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM21	YGR033C	VID24	P38263	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM21	YGR033C	MUP3	P38734	546 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM21	YGR033C	SMF1	P38925	575 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM21	YGR033C	ECM10	P39987	644 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM21	YGR033C	MET18	P40469	1032 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM21	YGR033C	MET28	P40573	187 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM21	YGR033C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIM21	YGR033C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM21	YGR033C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIM21	YGR033C	GRX6	Q12438	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM21	YGR033C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM21	YGR033C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIM21	YGR033C	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIM21	YGR033C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	GAL80	P04387	435 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	PCT1	P13259	424 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	REC107	P21651	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	ADH7	P25377	361 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	PTC6	P25646	442 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	SAS3	P34218	831 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	SDS3	P40505	327 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
TIM21	YGR033C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	HRD3	Q05787	833 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	AVL9	Q12500	764 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	RTC1	Q08281	1341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	YML133C	Q03099	1374 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	SPE2	P21182	396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	ALG5	P40350	334 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	YFR020W	P43600	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	IPI3	P53877	555 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	ARO10	Q06408	635 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	ATG29	Q12092	213 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	INP53	Q12271	1107 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	SGS1	P35187	1447 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	CCT6	P39079	546 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	UIP3	P39547	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	PHM8	P40025	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	PKP1	P40530	394 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	YJL043W	P47053	257 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	PET130	P47065	347 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	SGF73	P53165	657 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	NNF2	P53253	936 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	JJJ1	P53863	590 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	YNL058C	P53947	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	MAK10	Q02197	733 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	CYK3	Q07533	885 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	BI2	P03873	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	PMS1	P14242	873 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	PMA2	P19657	947 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	STB6	P36085	766 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	APE4	P38821	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	PTR3	P43606	678 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	FAR3	P46671	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	YGR127W	P53275	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	GND2	P53319	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	CIK1	Q01649	594 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	PUS9	Q12069	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	SPT7	P35177	1332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	PET111	P08468	800 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	AAD3	P25612	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	GCS1	P35197	352 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	CMC1	P36064	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	LTP1	P40347	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	JEM1	P40358	645 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	TDA10	P42938	290 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	GIS1	Q03833	894 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	YDR131C	Q03899	556 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.3 ms