RNA–Protein interactions for RNA: YFL039C

ACT1, Transcript of Actin, yeast

Gene ACT1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ACT1	YFL039C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
ACT1	YFL039C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	SLX1	P38324	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	AXL2	P38928	823 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	NPR2	P39923	615 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	ASK10	P48361	1146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	MDR1	P53258	950 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	TRI1	Q05024	226 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	VID22	Q05934	901 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	NDJ1	Q12366	352 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	RTN2	Q12443	393 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	GCN4	P03069	281 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	ARG3	P05150	338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	CLN1	P20437	546 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	KRE6	P32486	720 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	YEL043W	P32618	956 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	TGL1	P34163	548 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	YUH1	P35127	236 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	PCH2	P38126	564 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	SIF2	P38262	535 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	PEX32	P38292	413 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	IMO32	P53219	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	COQ6	P53318	479 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	YNR061C	P53747	219 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	YNR068C	P53754	272 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	OAZ1	Q02803	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	ARG7	Q04728	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	RSF1	Q05043	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	HOS1	Q12214	470 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	MET17	P06106	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	PCK1	P10963	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	CLC1	P17891	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	ADK2	P26364	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	HMX1	P32339	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	SUR1	P33300	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	SAW1	P39735	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	YER010C	P40011	234 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	OSW5	P40219	148 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	LTP1	P40347	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	PKP1	P40530	394 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	CGR1	P53188	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	TOF1	P53840	1238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	YNL144C	P53907	740 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	TOF2	Q02208	771 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	INP2	Q03824	705 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	TGS1	Q12052	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	ULA1	Q12059	462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	NUR1	Q12066	484 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	NUC1	P08466	329 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	WHI2	P12611	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	PMA2	P19657	947 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	VPS34	P22543	875 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	YMC1	P32331	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	MEI5	P32489	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	SDS22	P36047	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	MRPL40	P36534	297 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	TAF5	P38129	798 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	YPT10	P38146	199 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	UME6	P39001	836 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	NAS2	P40555	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	GSM1	P42950	618 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	YNL050C	P53952	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	AIM32	Q04689	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	SPH1	Q06160	661 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	PCD1	Q12524	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	PRE8	P23639	250 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	MSP1	P28737	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	DEP1	P31385	405 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	ACP1	P32463	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	ECM4	P36156	370 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	DAD2	P36162	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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