RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639439.1

PTPRVP-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRVP, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-204ENST00000639439 A0A0G2JMZ2 1700 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRVP-204ENST00000639439 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRVP-204ENST00000639439 EVI5O60447 810 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRVP-204ENST00000639439 ADORA2AP29274 412 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRVP-204ENST00000639439 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
PTPRVP-204ENST00000639439 NCAPG2Q86XI2 1143 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRVP-204ENST00000639439 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 F5H6K3 240 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 MSCO60682 206 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 PRDM1O75626 825 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 COPB2P35606 906 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 KLRC3Q07444 240 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 PPARAQ07869 468 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 TMEM132BQ14DG7 1078 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM83BQ5T0W9 1011 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 OLFML2BQ68BL8 750 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 SMC5Q8IY18 1101 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 NPLOC4Q8TAT6 608 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 MKL1Q969V6 931 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 FBXO28Q9NVF7 368 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 FLRT1Q9NZU1 646 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 CLIP2Q9UDT6 1046 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 VWA5AO00534 786 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 TTLL1O95922 423 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 LHX8Q68G74 356 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 NEDD1Q8NHV4 660 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 C11orf49Q9H6J7 331 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 HELLSQ9NRZ9 838 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 MTMR4Q9NYA4 1195 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 PLIN4Q96Q06 1357 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF236Q9UL36 1845 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 NDUFB10O96000 172 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 IGHA2P01877 340 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 TSPY3P0CV98 308 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 TSPY8P0CW00 308 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 FCER1AP12319 257 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 STAT3P40763 770 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 RIOX2Q8IUF8 465 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 CEP95Q96GE4 821 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 SLF1Q9BQI6 1058 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 LNPKQ9C0E8 428 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 CYP2C19P33261 490 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 COBLO75128 1261 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 TFAP4Q01664 338 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 ALX1Q15699 326 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 CHRDL2Q6WN34 429 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 REPS2Q8NFH8 660 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 MMP19Q99542 508 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 FOXP2O15409 715 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 CYBAP13498 195 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 CNGA1P29973 690 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 KCTD2Q14681 263 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 CHD1LQ86WJ1 897 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 TEX13BQ9BXU2 312 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 ANAPC4Q9UJX5 808 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 FEM1BQ9UK73 627 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 PARP14Q460N5 1801 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRVP-204ENST00000639439 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 ZBED4O75132 1171 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 COL6A1P12109 1028 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM47AQ5JRC9 791 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 EXOC6Q8TAG9 804 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 MAML3Q96JK9 1138 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 TSPY2A6NKD2 308 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 ATP2A1O14983 1001 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 FDX1P10109 184 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 NUCB1Q02818 461 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 VPS53Q5VIR6 699 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 SLFN13Q68D06 897 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 TRPV1Q8NER1 839 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM227BQ96M60 508 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 OSBPL3Q9H4L5 887 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 NRBP1Q9UHY1 535 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 PFASO15067 1338 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 A0A0D9SFI3 127 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 SEPT4O43236 478 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 IGHDP01880 384 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 BMP3P12645 472 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 CTDSPL2Q05D32 466 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
PTPRVP-204ENST00000639439 C7orf61Q8IZ16 206 aa18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.1 ms