RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	PDE6B	P35913	854 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	FXN	Q16595	210 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	C14orf80	Q86SX3	495 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	NIM1K	Q8IY84	436 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	NINJ1	Q92982	152 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	NFKB2	Q00653	900 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616		Q6ZS46	218 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF180	Q86T96	592 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	UBR7	Q8N806	425 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	FBXO27	Q8NI29	283 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR18	Q9BV38	432 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	RAD18	Q9NS91	495 aa		6.39	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616		B2RBV5	119 aa		6.38	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	AOC2	O75106	756 aa		6.38	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	PROC	P04070	461 aa		6.38	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	ITGB2	P05107	769 aa		6.38	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	LMNB1	P20700	586 aa		6.38	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	VPS72	Q15906	364 aa		6.38	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRC3	Q9BY71	257 aa		6.38	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		6.38	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		6.38	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	MCM8	Q9UJA3	840 aa		6.38	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		6.38	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		6.38	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		6.37	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		6.37	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	6.37	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	6.37	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	PDE8A	O60658	829 aa		6.37	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	MYL1	P05976	194 aa		6.37	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	6.37	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	6.37	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		6.37	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		6.37	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		6.37	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		6.37	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		6.37	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	SCYL1	Q96KG9	808 aa		6.37	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		6.37	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	CRBN	Q96SW2	442 aa		6.37	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		6.37	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		6.37	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		6.37	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	TIAF1	O95411	115 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	BPNT1	O95861	308 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	F13A1	P00488	732 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	SLFN14	P0C7P3	912 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	GLB1	P16278	677 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	ATF3	P18847	181 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB27A	P51159	221 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	FDX2	Q6P4F2	183 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	TMTC2	Q8N394	836 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	CEP41	Q9BYV8	373 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	PLCH2	O75038	1416 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	RASGRP1	O95267	797 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM153B	P0C7A2	387 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	DRD2	P14416	443 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	SOX5	P35711	763 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	GATA4	P43694	442 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	CASP7	P55210	303 aa		6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	6.36	□□□□□ -1.39
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		6.36	□□□□□ -1.39

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