RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614059.4

RPS6KC1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-208ENST00000614059 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa15.48■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 KRT5P13647 590 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 DNM2P50570 870 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 DENND2AQ9ULE3 1009 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 STAMBPO95630 424 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 COPB1P53618 953 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 NCAPH2Q6IBW4 605 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 CCDC105Q8IYK2 499 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 POLR3EQ9NVU0 708 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZMYM6O95789 1325 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 RNF40O75150 1001 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 CASP1P29466 404 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 MYO1AQ9UBC5 1043 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa15.47■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 CCDC151A5D8V7 595 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 TCIRG1Q13488 830 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 B4DLN1 442 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 BIRC3Q13489 604 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF365Q70YC5 407 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 FAM71BQ8TC56 605 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 C19orf44Q9H6X5 657 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 ST7Q9NRC1 585 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZBTB22O15209 634 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 PPP1R2P41236 205 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 CALCRLQ16602 461 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF804AQ7Z570 1209 aa15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
RPS6KC1-208ENST00000614059 FRMD3A2A2Y4 597 aa15.46■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM232C9JQI7 657 aa15.46■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 IFT88Q13099 833 aa15.46■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 VWA3BQ502W6 1294 aa15.46■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 USP37Q86T82 979 aa15.46■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 TET3O43151 1660 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 CLTAP09496 248 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 CDC25BP30305 580 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 IFNAR2P48551 515 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 IMPG2Q9BZV3 1241 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 MED4Q9NPJ6 270 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 HYOU1Q9Y4L1 999 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 ABCA6Q8N139 1617 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 IQGAP1P46940 1657 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 KIF1BO60333 1816 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 SMCO2A6NFE2 343 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 H7C1D1 291 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 FLOT1O75955 427 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 ALDH3A1P30838 453 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 RASSF7Q02833 373 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 ABCB6Q9NP58 842 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 ADAM21Q9UKJ8 722 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 KDRP35968 1356 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 IKBKBO14920 756 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 RPN1P04843 607 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 TRIML1Q8N9V2 468 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 EPSTI1Q96J88 318 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF131P52739 623 aa15.44■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 MAN1B1Q9UKM7 699 aa15.44■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 USTQ9Y2C2 406 aa15.44■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 KRIT1O00522 736 aa15.44■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 E2F5Q15329 346 aa15.44■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 BLIDQ8IZY5 108 aa15.44■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 M0R2C6 588 aa15.44■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 EXOC3O60645 756 aa15.44■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 GCNT3O95395 438 aa15.44■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 LTKP29376 864 aa15.44■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 IFT74Q96LB3 600 aa15.44■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 GREM2Q9H772 168 aa15.44■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 CCDC169A6NNP5 214 aa15.43■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 PRKAB2O43741 272 aa15.43■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 TCP1P17987 556 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 CASP8Q14790 479 aa15.43■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 VSTM4Q8IW00 320 aa15.43■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM87AQ8NBN3 555 aa15.43■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.43■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 VEZTQ9HBM0 779 aa15.43■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 PEX19P40855 299 aa15.43■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC7A5Q01650 507 aa15.43■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 USH1GQ495M9 461 aa15.43■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 CAPN12Q6ZSI9 719 aa15.43■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 KRT25Q7Z3Z0 450 aa15.43■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa15.43■□□□□ 0.06
RPS6KC1-208ENST00000614059 PPFIBP2Q8ND30 876 aa15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms