RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 BTBD7Q9P203 1132 aa23.1■■□□□ 1.29
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SGMS1-208ENST00000608287 RARBP10826 455 aa23.09■■□□□ 1.29
SGMS1-208ENST00000608287 ADD2P35612 726 aa23.09■■□□□ 1.29
SGMS1-208ENST00000608287 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.09■■□□□ 1.29
SGMS1-208ENST00000608287 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.09■■□□□ 1.29
SGMS1-208ENST00000608287 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa23.09■■□□□ 1.29
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SGMS1-208ENST00000608287 EHD4Q9H223 541 aa23.09■■□□□ 1.29
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SGMS1-208ENST00000608287 MYH7P12883 1935 aa23.08■■□□□ 1.29
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SGMS1-208ENST00000608287 TTC6Q86TZ1 520 aa23.07■■□□□ 1.28
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SGMS1-208ENST00000608287 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa23.05■■□□□ 1.28
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SGMS1-208ENST00000608287 SMC5Q8IY18 1101 aa23■■□□□ 1.27
SGMS1-208ENST00000608287 ACER1Q8TDN7 264 aa23■■□□□ 1.27
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SGMS1-208ENST00000608287 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SGMS1-208ENST00000608287 MYO9BQ13459 2157 aa23■■□□□ 1.27
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SGMS1-208ENST00000608287 SLC25A27O95847 323 aa22.99■■□□□ 1.27
SGMS1-208ENST00000608287 TIMP1P01033 207 aa22.99■■□□□ 1.27
SGMS1-208ENST00000608287 AKR1A1P14550 325 aa22.99■■□□□ 1.27
SGMS1-208ENST00000608287 PLCD1P51178 756 aa22.99■■□□□ 1.27
SGMS1-208ENST00000608287 PLS1Q14651 629 aa22.99■■□□□ 1.27
SGMS1-208ENST00000608287 RAB30Q15771 203 aa22.99■■□□□ 1.27
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