RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599236.5

FCHO1-228, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-228ENST00000599236 BCL11AQ9H165 835 aa17.11■□□□□ 0.33
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF236Q9UL36 1845 aa17.11■□□□□ 0.33
FCHO1-228ENST00000599236 REV3LO60673 3130 aa17.11■□□□□ 0.33
FCHO1-228ENST00000599236 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
FCHO1-228ENST00000599236 PARP14Q460N5 1801 aa17.1■□□□□ 0.33
FCHO1-228ENST00000599236 PGK1P00558 417 aa17.1■□□□□ 0.33
FCHO1-228ENST00000599236 SIRT2Q8IXJ6 389 aa17.1■□□□□ 0.33
FCHO1-228ENST00000599236 MROH8Q9H579 483 aa17.1■□□□□ 0.33
FCHO1-228ENST00000599236 VCPKMTQ9H867 229 aa17.1■□□□□ 0.33
FCHO1-228ENST00000599236 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa17.1■□□□□ 0.33
FCHO1-228ENST00000599236 CDK8P49336 464 aa17.09■□□□□ 0.33
FCHO1-228ENST00000599236 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
FCHO1-228ENST00000599236 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
FCHO1-228ENST00000599236 ABRAQ8N0Z2 381 aa17.09■□□□□ 0.33
FCHO1-228ENST00000599236 MBD4O95243 580 aa17.08■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 FCER1AP12319 257 aa17.08■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 ICA1Q05084 483 aa17.08■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF792Q3KQV3 632 aa17.08■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 C1orf53Q5VUE5 145 aa17.08■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 ERC1Q8IUD2 1116 aa17.08■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 MB21D1Q8N884 522 aa17.08■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 REPS2Q8NFH8 660 aa17.08■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP17.08■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 BOLA2Q9H3K6 86 aa17.08■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 PHF24Q9UPV7 400 aa17.08■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 USP17L12C9JPN9 530 aa17.07■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 USP17L21D6R901 530 aa17.07■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 EEF2P13639 858 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 ADD2P35612 726 aa17.07■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 C12orf60Q5U649 245 aa17.07■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 MMP19Q99542 508 aa17.07■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa17.07■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 SWAP70Q9UH65 585 aa17.07■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 NCOR1O75376 2440 aa17.07■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 MYH8P13535 1937 aa17.06■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa17.06■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP17.06■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 TINF2Q9BSI4 451 aa17.06■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa17.06■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 VWA5AO00534 786 aa17.05■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 KIAA0355O15063 1070 aa17.05■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 WDR46O15213 610 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 STAT3P40763 770 aa17.05■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 C16orf86Q6ZW13 317 aa17.05■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 RIOX2Q8IUF8 465 aa17.05■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 SLC5A4Q9NY91 659 aa17.05■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 RIPK3Q9Y572 518 aa17.05■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 TACC3Q9Y6A5 838 aa17.05■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 A0A1W2PQY0 241 aa17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 ADAMTS4O75173 837 aa17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 SLC25A27O95847 323 aa17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 CLTBP09497 229 aa17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 RARBP10826 455 aa17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 FAAP100Q0VG06 881 aa17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 GRIN2CQ14957 1233 aa17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 FAM83BQ5T0W9 1011 aa17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 CTR9Q6PD62 1173 aa17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 USP38Q8NB14 1042 aa17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 PAG1Q9NWQ8 432 aa17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 XIRP2A4UGR9 3374 aa17.04■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 MYADML2A6NDP7 307 aa17.03■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 KIF1BPQ96EK5 621 aa17.03■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 CCDC17Q96LX7 622 aa17.03■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 BDP1A6H8Y1 2624 aa17.03■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 MCM3APO60318 1980 aa17.02■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 ADCY6O43306 1168 aa17.02■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP17.02■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa17.02■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 C16orf59Q7L2K0 433 aa17.02■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 RNF180Q86T96 592 aa17.02■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 STK11IPQ8N1F8 1099 aa17.02■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 KLHDC9Q8NEP7 349 aa17.02■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 PRDM6Q9NQX0 595 aa17.02■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 TMEM39AQ9NV64 488 aa17.02■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 NRBP1Q9UHY1 535 aa17.02■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
FCHO1-228ENST00000599236 ZBED9Q6R2W3 1325 aa17.01■□□□□ 0.31
FCHO1-228ENST00000599236 RAD21O60216 631 aa17.01■□□□□ 0.31
FCHO1-228ENST00000599236 FOSL2P15408 326 aa17.01■□□□□ 0.31
FCHO1-228ENST00000599236 RAG1P15918 1043 aa17.01■□□□□ 0.31
FCHO1-228ENST00000599236 ATP5JP18859 108 aa17.01■□□□□ 0.31
FCHO1-228ENST00000599236 ACLYP53396 1101 aa17.01■□□□□ 0.31
FCHO1-228ENST00000599236 KCTD2Q14681 263 aa17.01■□□□□ 0.31
FCHO1-228ENST00000599236 KCNA10Q16322 511 aa17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms