RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592358.1

UBXN6-208, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 2

Gene UBXN6, Length 626 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-208ENST00000592358 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP18.27■□□□□ 0.52
UBXN6-208ENST00000592358 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa18.26■□□□□ 0.51
UBXN6-208ENST00000592358 PPFIA3O75145 1194 aa18.26■□□□□ 0.51
UBXN6-208ENST00000592358 SLC34A2O95436 690 aa18.26■□□□□ 0.51
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UBXN6-208ENST00000592358 FOSBP53539 338 aa18.26■□□□□ 0.51
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UBXN6-208ENST00000592358 MYH4Q9Y623 1939 aa18.23■□□□□ 0.51
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UBXN6-208ENST00000592358 ASPRV1Q53RT3 343 aa18.2■□□□□ 0.5
UBXN6-208ENST00000592358 KRT40Q6A162 431 aa18.2■□□□□ 0.5
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UBXN6-208ENST00000592358 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
UBXN6-208ENST00000592358 WNK4Q96J92 1243 aa18.2■□□□□ 0.5
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UBXN6-208ENST00000592358 ELP3Q9H9T3 547 aa18.2■□□□□ 0.5
UBXN6-208ENST00000592358 MAD2L2Q9UI95 211 aa18.2■□□□□ 0.5
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UBXN6-208ENST00000592358 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
UBXN6-208ENST00000592358 KRT85P78386 507 aa18.19■□□□□ 0.5
UBXN6-208ENST00000592358 SREBF2Q12772 1141 aa18.19■□□□□ 0.5
UBXN6-208ENST00000592358 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
UBXN6-208ENST00000592358 SEPT2Q15019 361 aa18.19■□□□□ 0.5
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UBXN6-208ENST00000592358 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP18.19■□□□□ 0.5
UBXN6-208ENST00000592358 AIFM3Q96NN9 605 aa18.19■□□□□ 0.5
UBXN6-208ENST00000592358 V9GY48 417 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
UBXN6-208ENST00000592358 KLRF2D3W0D1 207 aa18.18■□□□□ 0.5
UBXN6-208ENST00000592358 GH2P01242 217 aa18.18■□□□□ 0.5
UBXN6-208ENST00000592358 EEF2P13639 858 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
UBXN6-208ENST00000592358 SMARCA1P28370 1054 aa18.18■□□□□ 0.5
UBXN6-208ENST00000592358 TM4SF4P48230 202 aa18.18■□□□□ 0.5
UBXN6-208ENST00000592358 MAP3K9P80192 1104 aa18.18■□□□□ 0.5
UBXN6-208ENST00000592358 VGLL4Q14135 290 aa18.18■□□□□ 0.5
UBXN6-208ENST00000592358 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa18.18■□□□□ 0.5
UBXN6-208ENST00000592358 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
UBXN6-208ENST00000592358 MIGA2Q7L4E1 593 aa18.18■□□□□ 0.5
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