RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 LTBP2Q14767 1821 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX17Q15036 470 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE3CQ15386 1083 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM60Q495X7 471 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM47AQ5JRC9 791 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 AMOTL1Q8IY63 956 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC41Q15345 812 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 GUCD1Q96NT3 240 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 PARP14Q460N5 1801 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 MYH8P13535 1937 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A27O95847 323 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 ADCYAP1R1P41586 468 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 CTR9Q6PD62 1173 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 FERMT2Q96AC1 680 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 MMP19Q99542 508 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 KANSL2Q9H9L4 492 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 PGK2P07205 417 aa30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 DDRGK1Q96HY6 314 aa30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 RIOX2Q8IUF8 465 aa30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM161BQ96MY7 647 aa30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 PDLIM7Q9NR12 457 aa30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 VWA5AO00534 786 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 SHHQ15465 462 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 C9orf50Q5SZB4 431 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM83BQ5T0W9 1011 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 GOPCQ9HD26 462 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 REPS2Q8NFH8 660 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 BADQ92934 168 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 RAD21O60216 631 aa30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 STAT3P40763 770 aa30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF792Q3KQV3 632 aa30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf53Q5VUE5 145 aa30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 NRBP1Q9UHY1 535 aa30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM43BA6NCK2 446 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 KCTD2Q14681 263 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 TINF2Q9BSI4 451 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRCC1Q9C099 1032 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 PHF24Q9UPV7 400 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 RARBP10826 455 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0C4DFX4 3053 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 PGK1P00558 417 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF697Q5TEC3 545 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ROBO3Q96MS0 1386 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 TLE2Q04725 743 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 STK11IPQ8N1F8 1099 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 MYH7P12883 1935 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 RASA1P20936 1047 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGB8P26012 769 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 COPB2P35606 906 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 SBK1Q52WX2 424 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF180Q86T96 592 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 SLF1Q9BQI6 1058 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 GSG1L2A8MUP6 293 aa30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 AKR1A1P14550 325 aa30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 C20orf194Q5TEA3 1177 aa30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 ECHDC1Q9NTX5 307 aa30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PQY0 241 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 TEX13BQ9BXU2 312 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 NYAP2Q9P242 653 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 RCAN3Q9UKA8 241 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 RIPK3Q9Y572 518 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTS4O75173 837 aa30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFB10O96000 172 aa30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 OSBP2Q969R2 916 aa30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 MKNK2Q9HBH9 465 aa30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 CNPY2Q9Y2B0 182 aa30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 TACC3Q9Y6A5 838 aa30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 MINDY4BA8MYZ0 360 aa30.7■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 F5H6K3 240 aa30.7■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 CLTBP09497 229 aa30.7■■■□□ 2.51
CAPNS1-211ENST00000590874 KLRC3Q07444 240 aa30.7■■■□□ 2.51
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