RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ADM5C9JUS6 153 aa35.88■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 SCG2P13521 617 aa35.87■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 INPP5BP32019 993 aa35.87■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 NFKBIBQ15653 356 aa35.87■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC96Q2M329 555 aa35.87■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT40Q6A162 431 aa35.87■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 AIFM3Q96NN9 605 aa35.87■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 CYTH3O43739 400 aa35.86■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFB10O96000 172 aa35.86■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 VCPKMTQ9H867 229 aa35.86■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 AS3MTQ9HBK9 375 aa35.86■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 SH3GLB2Q9NR46 395 aa35.86■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLGA6L22H0YM25 854 aa35.86■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 RASGRP2Q7LDG7 609 aa35.86■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 PICK1Q9NRD5 415 aa35.86■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 ECE1P42892 770 aa35.85■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 RESTQ13127 1097 aa35.85■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP35.85■■■■□ 3.338e-20■■□□□ 14.3
CAPNS1-206ENST00000588815 ACER1Q8TDN7 264 aa35.85■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 hCG_1984214I3L0E3 225 aa35.84■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 USP2O75604 605 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 BMP3P12645 472 aa35.84■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 MCM4P33991 863 aa35.84■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 FOSBP53539 338 aa35.84■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 GUCY1B3Q02153 619 aa35.84■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP35.84■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR18Q9BV38 432 aa35.84■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2Q2LH0YL09 131 aa35.83■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 PTMSP20962 102 aa35.83■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC35G1Q2M3R5 365 aa35.83■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 BRAPQ7Z569 592 aa35.83■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 FERMT3Q86UX7 667 aa35.83■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 CDCA5Q96FF9 252 aa35.83■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 GPCPD1Q9NPB8 672 aa35.83■■■■□ 3.33
CAPNS1-206ENST00000588815 DDX11L8A8MPP1 907 aa35.82■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 MMP1P03956 469 aa35.82■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 MCTP1Q6DN14 999 aa35.82■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa35.82■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 RAD21O60216 631 aa35.81■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 IREB2P48200 963 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 KCTD1Q719H9 257 aa35.81■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 LPAR1Q92633 364 aa35.81■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP3K9P80192 1104 aa35.8■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 ATL3Q6DD88 541 aa35.8■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa35.8■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 BTNL9Q6UXG8 535 aa35.8■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 FEZ1Q99689 392 aa35.8■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 UBA5Q9GZZ9 404 aa35.8■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC11AQ9Y240 323 aa35.8■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 PTPRAP18433 802 aa35.8■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 USP14P54578 494 aa35.8■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 PHF20Q9BVI0 1012 aa35.8■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 RRAGCQ9HB90 399 aa35.8■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 GJB4Q9NTQ9 266 aa35.8■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 PTPRFP10586 1907 aa35.79■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa35.79■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 PLA2G6O60733 806 aa35.79■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP3K11Q16584 847 aa35.79■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC148Q8NFR7 591 aa35.79■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 MTMR8Q96EF0 704 aa35.79■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 USP17L10C9JJH3 530 aa35.78■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP35.78■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 ADGRF4Q8IZF3 695 aa35.78■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 BRMS1Q9HCU9 246 aa35.78■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 VPS54Q9P1Q0 977 aa35.78■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 CALML3P27482 149 aa35.77■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 TTBK2Q6IQ55 1244 aa35.77■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 LDHDQ86WU2 507 aa35.77■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 JMJD4Q9H9V9 463 aa35.77■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 BARHL2Q9NY43 387 aa35.77■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT85P78386 507 aa35.76■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 GALNT17Q6IS24 598 aa35.76■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF280CQ8ND82 737 aa35.76■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 PIGSQ96S52 555 aa35.76■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 CPVLQ9H3G5 476 aa35.76■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 CSADQ9Y600 493 aa35.76■■■■□ 3.32
CAPNS1-206ENST00000588815 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa35.75■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 CHURC1Q8WUH1 139 aa35.75■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 VAT1LQ9HCJ6 419 aa35.75■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 PARP14Q460N5 1801 aa35.75■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 C19orf81C9J6K1 198 aa35.74■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR46O15213 610 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 STAT2P52630 851 aa35.74■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa35.74■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM232C9JQI7 657 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB5O15062 677 aa35.73■■■■□ 3.31
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