RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571409.1

CTDNEP1-206, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-206ENST00000571409 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
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CTDNEP1-206ENST00000571409 RILPL2Q969X0 211 aa36.1■■■■□ 3.37
CTDNEP1-206ENST00000571409 CEP95Q96GE4 821 aa36.1■■■■□ 3.37
CTDNEP1-206ENST00000571409 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
CTDNEP1-206ENST00000571409 A0A0D9SFI3 127 aa36.09■■■■□ 3.37
CTDNEP1-206ENST00000571409 TSPY3P0CV98 308 aa36.09■■■■□ 3.37
CTDNEP1-206ENST00000571409 TSPY8P0CW00 308 aa36.09■■■■□ 3.37
CTDNEP1-206ENST00000571409 TICAM2Q86XR7 235 aa36.09■■■■□ 3.37
CTDNEP1-206ENST00000571409 PLIN4Q96Q06 1357 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-206ENST00000571409 F5H6K3 240 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-206ENST00000571409 KLRC3Q07444 240 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-206ENST00000571409 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-206ENST00000571409 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-206ENST00000571409 HTATIP2Q9BUP3 242 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-206ENST00000571409 MTMR4Q9NYA4 1195 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-206ENST00000571409 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-206ENST00000571409 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZNF236Q9UL36 1845 aa36.08■■■■□ 3.37
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CTDNEP1-206ENST00000571409 TMEM132BQ14DG7 1078 aa36.07■■■■□ 3.36
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CTDNEP1-206ENST00000571409 NCAPG2Q86XI2 1143 aa36.07■■■■□ 3.36
CTDNEP1-206ENST00000571409 NEDD1Q8NHV4 660 aa36.07■■■■□ 3.36
CTDNEP1-206ENST00000571409 NPLOC4Q8TAT6 608 aa36.07■■■■□ 3.36
CTDNEP1-206ENST00000571409 DPF3Q92784 378 aa36.07■■■■□ 3.36
CTDNEP1-206ENST00000571409 OSBPL3Q9H4L5 887 aa36.07■■■■□ 3.36
CTDNEP1-206ENST00000571409 MROH8Q9H579 483 aa36.07■■■■□ 3.36
CTDNEP1-206ENST00000571409 FLRT1Q9NZU1 646 aa36.07■■■■□ 3.36
CTDNEP1-206ENST00000571409 STRNO43815 780 aa36.06■■■■□ 3.36
CTDNEP1-206ENST00000571409 TTLL1O95922 423 aa36.06■■■■□ 3.36
CTDNEP1-206ENST00000571409 NDUFB10O96000 172 aa36.06■■■■□ 3.36
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CTDNEP1-206ENST00000571409 CTDSPL2Q05D32 466 aa36.06■■■■□ 3.36
CTDNEP1-206ENST00000571409 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
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CTDNEP1-206ENST00000571409 DPP9Q86TI2 863 aa36.05■■■■□ 3.36
CTDNEP1-206ENST00000571409 MKL1Q969V6 931 aa36.05■■■■□ 3.36
CTDNEP1-206ENST00000571409 VWA5AO00534 786 aa36.04■■■■□ 3.36
CTDNEP1-206ENST00000571409 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
CTDNEP1-206ENST00000571409 MFSD14CQ5VZR4 134 aa36.04■■■■□ 3.36
CTDNEP1-206ENST00000571409 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP36.04■■■■□ 3.36
CTDNEP1-206ENST00000571409 ALX1Q15699 326 aa36.03■■■■□ 3.36
CTDNEP1-206ENST00000571409 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
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CTDNEP1-206ENST00000571409 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa36.03■■■■□ 3.36
CTDNEP1-206ENST00000571409 SLC25A27O95847 323 aa36.02■■■■□ 3.36
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CTDNEP1-206ENST00000571409 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
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CTDNEP1-206ENST00000571409 ANAPC4Q9UJX5 808 aa36.02■■■■□ 3.36
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CTDNEP1-206ENST00000571409 SDSP20132 328 aa36■■■■□ 3.35
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CTDNEP1-206ENST00000571409 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa36■■■■□ 3.35
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CTDNEP1-206ENST00000571409 BMP3P12645 472 aa35.93■■■■□ 3.34
CTDNEP1-206ENST00000571409 CNGA1P29973 690 aa35.93■■■■□ 3.34
CTDNEP1-206ENST00000571409 TEX13BQ9BXU2 312 aa35.93■■■■□ 3.34
CTDNEP1-206ENST00000571409 TOMM22Q9NS69 142 aa35.93■■■■□ 3.34
CTDNEP1-206ENST00000571409 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
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