RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 SNED1Q8TER0 1413 aa26.37■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 CASP1P29466 404 aa26.37■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 PTPN21Q16825 1174 aa26.37■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 TMEM47Q9BQJ4 181 aa26.37■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 E2F4Q16254 413 aa26.36■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 TEX11Q8IYF3 940 aa26.36■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 TMX1Q9H3N1 280 aa26.36■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 BBOX1O75936 387 aa26.36■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 TYW1BQ6NUM6 668 aa26.36■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 GSDMAQ96QA5 445 aa26.36■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.36■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 MYH1P12882 1939 aa26.36■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 C4orf32Q8N8J7 132 aa26.35■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 ANKRD7Q92527 254 aa26.35■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 ZNF287Q9HBT7 754 aa26.35■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.35■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 LTBP1Q14766 1721 aa26.35■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 M0R2N6 131 aa26.34■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 CYTH3O43739 400 aa26.34■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 CD44P16070 742 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 CDK8P49336 464 aa26.34■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 CUL4BQ13620 913 aa26.34■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 WWC2Q6AWC2 1192 aa26.34■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 C16orf86Q6ZW13 317 aa26.34■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.34■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 POLLQ9UGP5 575 aa26.34■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 STX8Q9UNK0 236 aa26.34■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 PLCG2P16885 1265 aa26.34■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 DDR1Q08345 913 aa26.34■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 GOLGA8FQ08AF8 430 aa26.34■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa26.34■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 SYCP1Q15431 976 aa26.34■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 IQUBQ8NA54 791 aa26.34■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 RASGRP4Q8TDF6 673 aa26.34■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 FLT1P17948 1338 aa26.34■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 MFSD14BQ5SR56 506 aa26.33■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 PDXDC2PQ6P474 469 aa26.33■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 DAGLBQ8NCG7 672 aa26.33■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 MTMR7Q9Y216 660 aa26.33■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 FOCADQ5VW36 1801 aa26.33■■□□□ 1.81
EHD4-202ENST00000569223 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa26.33■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 RHBDL3P58872 404 aa26.32■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.32■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 CCDC148Q8NFR7 591 aa26.32■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 KIF18AQ8NI77 898 aa26.32■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 EYA3Q99504 573 aa26.32■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 LZTS2Q9BRK4 669 aa26.32■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 STXBP3O00186 592 aa26.32■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 SPATA1Q5VX52 437 aa26.32■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.32■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 PCDHA6Q9UN73 950 aa26.32■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa26.32■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 GAKO14976 1311 aa26.31■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 LONP1P36776 959 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa26.31■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 STAMQ92783 540 aa26.31■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 BARHL2Q9NY43 387 aa26.31■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa26.31■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa26.31■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 GALNT17Q6IS24 598 aa26.31■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 KLHL10Q6JEL2 608 aa26.31■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 TMEM139Q8IV31 216 aa26.31■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 SLF2Q8IX21 1173 aa26.31■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 NEDD1Q8NHV4 660 aa26.31■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.31■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 CCP110O43303 1012 aa26.3■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa26.3■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 A0A1B0GTH6 734 aa26.29■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 GOLGA8HP0CJ92 632 aa26.29■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 STX17P56962 302 aa26.29■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 NR1I3Q14994 352 aa26.29■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 BLZF1Q9H2G9 400 aa26.29■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 RASGRP2Q7LDG7 609 aa26.29■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 MTRQ99707 1265 aa26.29■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 SPZ1Q9BXG8 430 aa26.29■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 KLRF2D3W0D1 207 aa26.28■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 C6orf229H3BNL8 230 aa26.28■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 CDKAL1Q5VV42 579 aa26.27■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 FCHSD1Q86WN1 690 aa26.27■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.27■■□□□ 1.8
EHD4-202ENST00000569223 TUBB4AP04350 444 aa26.26■■□□□ 1.79
EHD4-202ENST00000569223 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
EHD4-202ENST00000569223 TXLNAP40222 546 aa26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms