RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	TSPY3	P0CV98	308 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	TSPY8	P0CW00	308 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	ADORA2A	P29274	412 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	TFAP4	Q01664	338 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	MKL1	Q969V6	931 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	RILPL2	Q969X0	211 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	BRCA2	P51587	3418 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	VWA5A	O00534	786 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	EVI5	O60447	810 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	TTLL1	O95922	423 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	FCER1A	P12319	257 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	STAT3	P40763	770 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	NUCB1	Q02818	461 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	CEP95	Q96GE4	821 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	NBPF3	Q9H094	633 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	FOXP2	O15409	715 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	COBL	O75128	1261 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	NDUFB10	O96000	172 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	CNGA1	P29973	690 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP2C19	P33261	490 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	ALX1	Q15699	326 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	VPS53	Q5VIR6	699 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM227B	Q96M60	508 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	TSPY2	A6NKD2	308 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	ZBED4	O75132	1171 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC34A2	O95436	690 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	FGA	P02671	866 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	COPB2	P35606	906 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	KCTD2	Q14681	263 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	LHX8	Q68G74	356 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	MMP19	Q99542	508 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	INCENP	Q9NQS7	918 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	FEM1B	Q9UK73	627 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	MYH7	P12883	1935 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A0D9SFI3	127 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	MSC	O60682	206 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	IGHA2	P01877	340 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	SDS	P20132	328 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC4A3	P48751	1232 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	SLFN13	Q68D06	897 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	REPS2	Q8NFH8	660 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	KIFC2	Q96AC6	838 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	TOMM22	Q9NS69	142 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	STX8	Q9UNK0	236 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	PLXNB2	O15031	1838 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	FGR	P09769	529 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	BMP3	P12645	472 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	CPXCR1	Q8N123	301 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	MAML3	Q96JK9	1138 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-231	ENST00000567479	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63

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