RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566452.1

BBS2-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 2

Gene BBS2, Length 299 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-215	ENST00000566452	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	CDC6	Q99741	560 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	CORO1B	Q9BR76	489 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	CUL7	Q14999	1698 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	TOP2B	Q02880	1626 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	KIF3B	O15066	747 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	EPHA1	P21709	976 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	NOS3	P29474	1203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	ADH7	P40394	386 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	CCNF	P41002	786 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	CDK8	P49336	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	ARL4D	P49703	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	GSTM4	Q03013	218 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	MAP7	Q14244	749 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	WNT8B	Q93098	351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	EXOC2	Q96KP1	924 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	SLC9A7	Q96T83	725 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	KLHL3	Q9UH77	587 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	NAGPA	Q9UK23	515 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	DNAJA2	O60884	412 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	TGFB1	P01137	390 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	RAG1	P15918	1043 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	PIP4K2B	P78356	416 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	INPP5A	Q14642	412 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	SMC5	Q8IY18	1101 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	RIN3	Q8TB24	985 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	TTC9	Q92623	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	KIF21B	O75037	1637 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	NUP160	Q12769	1436 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	TSPAN6	O43657	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	PGR	P06401	933 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	SPINK2	P20155	84 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	L1CAM	P32004	1257 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	GUCY2F	P51841	1108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	PPP2R5A	Q15172	486 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	POU4F3	Q15319	338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	SV2C	Q496J9	727 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	UBR7	Q8N806	425 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	PMM1	Q92871	262 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452		A0A1W2PQU0	124 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-215	ENST00000566452	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 540.6 ms