RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 XBP1P17861 261 aa23.09■■□□□ 1.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.09■■□□□ 1.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMCO3Q6UWJ1 677 aa23.09■■□□□ 1.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.09■■□□□ 1.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRRN4CLQ8ND94 238 aa23.09■■□□□ 1.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 UBXN4Q92575 508 aa23.09■■□□□ 1.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
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CCNDBP1-205ENST00000564630 PKN1Q16512 942 aa23.09■■□□□ 1.29
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CCNDBP1-205ENST00000564630 SMARCE1Q969G3 411 aa23.09■■□□□ 1.29
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CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM232C9JQI7 657 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPSM2P81274 684 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 FUT2Q10981 343 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 MORC3Q14149 939 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 KANK3Q6NY19 840 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 REXO1L1PQ8IX06 675 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIML1Q8N9V2 468 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 CSRNP2Q9H175 543 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 ST7Q9NRC1 585 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 RNF181Q9P0P0 153 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 FGRP09769 529 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 TOP1P11387 765 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 PCP11498 1178 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATP2B1P20020 1258 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMC4Q7Z404 712 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 CATIPQ7Z7H3 387 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 PHF20Q9BVI0 1012 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 KRT2P35908 639 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 MUM1L1Q5H9M0 696 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 TEX35Q5T0J7 233 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF384Q8TF68 577 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 INTS13Q9NVM9 706 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZSCAN12O43309 604 aa23.06■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM75PA6NK02 468 aa23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.282e-6■■■■□ 24.2
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CCNDBP1-205ENST00000564630 IQCA1Q86XH1 822 aa23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 PDILTQ8N807 584 aa23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 LTBP1Q14766 1721 aa23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM205CA6NFA0 338 aa23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 CALM1P0DP23 149 aa23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 CALM2P0DP24 149 aa23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 CALM3P0DP25 149 aa23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 LMNB1P20700 586 aa23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPATA20Q8TB22 786 aa23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARHGAP6O43182 974 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 PLEKHA8P1O95397 391 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF18P17022 549 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 CTR9Q6PD62 1173 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 HOMER1Q86YM7 354 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 PSMD1Q99460 953 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRDM1O75626 825 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 TROAPQ12815 778 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM139Q8IV31 216 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 TXLNBQ8N3L3 684 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 SEMA3EO15041 775 aa23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 DDAH1O94760 285 aa23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 MNS1Q8NEH6 495 aa23.03■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.02■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 FANCGO15287 622 aa23.02■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 POLLQ9UGP5 575 aa23.02■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 COL4A5P29400 1685 aa23.02■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 C6orf229H3BNL8 230 aa23.02■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 YY1P25490 414 aa23.02■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAP3K9P80192 1104 aa23.02■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 GOLGA8FQ08AF8 430 aa23.02■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa23.02■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 PTPN21Q16825 1174 aa23.02■■□□□ 1.28
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