RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	KLRK1	P26718	216 aa		20.84	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	CASP1	P29466	404 aa		20.84	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	PRDX5	P30044	214 aa		20.84	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	MCM7	P33993	719 aa		20.84	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	20.84	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	BLID	Q8IZY5	108 aa		20.84	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	ANKS1A	Q92625	1134 aa		20.84	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	20.83	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		20.83	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		20.83	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		20.83	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	20.83	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	KIFC2	Q96AC6	838 aa		20.83	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		20.83	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		20.83	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		20.83	■□□□□ 0.93
RRN3-205	ENST00000563559	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	20.83	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	ATP8B1	O43520	1251 aa		20.83	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	PAK1	Q13153	545 aa		20.83	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM14	Q14142	442 aa		20.83	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	20.83	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	GALNT17	Q6IS24	598 aa		20.83	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	20.83	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		20.83	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		20.83	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		20.83	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		20.82	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	SEMA3F	Q13275	785 aa		20.82	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	TUBB2A	Q13885	445 aa		20.82	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		20.82	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	DESI2	Q9BSY9	194 aa		20.82	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		20.82	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		20.81	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	KIF5C	O60282	957 aa		20.81	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	CYP2D6	P10635	497 aa		20.81	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	FECH	P22830	423 aa		20.81	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		20.81	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		20.81	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	N4BP3	O15049	544 aa		20.81	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	ZPR1	O75312	459 aa		20.81	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	MYL1	P05976	194 aa		20.81	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	TFAP4	Q01664	338 aa		20.81	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	C12orf60	Q5U649	245 aa		20.81	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		20.81	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	PNMA1	Q8ND90	353 aa		20.81	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		20.81	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	20.81	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		20.81	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		20.81	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	RPS6KA4	O75676	772 aa		20.8	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	20.8	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	20.8	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	KRT31	Q15323	416 aa		20.8	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	IL17A	Q16552	155 aa		20.8	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		20.8	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		20.8	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	20.8	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	20.8	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	20.8	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	CASP14	P31944	242 aa		20.8	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	STAT6	P42226	847 aa		20.8	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	GSTO1	P78417	241 aa		20.8	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	EVX2	Q03828	476 aa		20.8	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	GRM4	Q14833	912 aa		20.8	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	TERF2	Q15554	542 aa		20.8	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		20.8	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	RABGGTA	Q92696	567 aa		20.8	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	STAM	Q92783	540 aa		20.8	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		20.79	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	GYPC	P04921	128 aa		20.79	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	USP5	P45974	858 aa		20.79	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	TUBB4B	P68371	445 aa		20.79	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	MTF1	Q14872	753 aa		20.79	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	20.79	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		20.79	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	20.79	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA1	Q92805	767 aa		20.79	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	MTR	Q99707	1265 aa		20.79	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		20.79	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	20.79	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		20.79	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		20.79	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559		H7C1D1	291 aa		20.78	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	LAD1	O00515	517 aa		20.78	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	BAG3	O95817	575 aa		20.78	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	20.78	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	USP17L8	P0C7I0	530 aa		20.78	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		20.78	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		20.78	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		20.78	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	20.78	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		20.78	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	NELFB	Q8WX92	580 aa		20.78	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		20.78	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	20.78	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		20.78	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		20.78	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	DISC1	Q9NRI5	854 aa		20.78	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	20.77	■□□□□ 0.92
RRN3-205	ENST00000563559	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	20.77	■□□□□ 0.92

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