RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561256.5

USP3-AS1-210, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC17Q96LX7 622 aa20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 MMP19Q99542 508 aa20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 UNC80Q8N2C7 3258 aa20.83■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRIM43BA6NCK2 446 aa20.82■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.82■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.82■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 NRBP1Q9UHY1 535 aa20.82■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 PHF24Q9UPV7 400 aa20.82■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 PGK2P07205 417 aa20.81■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 ADD2P35612 726 aa20.81■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 CDK8P49336 464 aa20.81■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 TLE2Q04725 743 aa20.81■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 KCTD2Q14681 263 aa20.81■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 RNF180Q86T96 592 aa20.81■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.81■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.81■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 PARP14Q460N5 1801 aa20.81■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 RAD21O60216 631 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 HMMRO75330 724 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 C12orf60Q5U649 245 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 TINF2Q9BSI4 451 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 USP17L12C9JPN9 530 aa20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 USP17L21D6R901 530 aa20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 SMIM22K7EJ46 135 aa20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 PGK1P00558 417 aa20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 CLTBP09497 229 aa20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 STAT3P40763 770 aa20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 GOPCQ9HD26 462 aa20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 VWA5AO00534 786 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 MYLIPQ8WY64 445 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.78■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 AKR1A1P14550 325 aa20.77■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 RAG1P15918 1043 aa20.77■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 ITGB8P26012 769 aa20.77■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 COPB2P35606 906 aa20.77■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.77■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.77■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.77■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
USP3-AS1-210ENST00000561256 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.76■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.76■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 A0A1W2PQY0 241 aa20.76■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 RAB11FIP3O75154 756 aa20.76■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 FOSL2P15408 326 aa20.76■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 ATP5JP18859 108 aa20.76■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.76■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 KIAA0355O15063 1070 aa20.75■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 UBE3CQ15386 1083 aa20.75■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 HAUS7Q99871 368 aa20.75■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM39AQ9NV64 488 aa20.75■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 CHGBP05060 677 aa20.74■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 EPHB4P54760 987 aa20.74■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 FPGSQ05932 587 aa20.74■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 CTR9Q6PD62 1173 aa20.74■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 REPS2Q8NFH8 660 aa20.74■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 STARD7Q9NQZ5 370 aa20.74■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.73■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 ADAMTS4O75173 837 aa20.73■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.73■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.73■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.73■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.73■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.73■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 DCDC2CA8MYV0 355 aa20.72■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 ACLYP53396 1101 aa20.72■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms