RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 HDAC5Q9UQL6 1122 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 WDR64B1ANS9 1081 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 LINC01387J3KSC0 135 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 CRKLP46109 303 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 TGFB2P61812 414 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 TMF1P82094 1093 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 CLEC4GQ6UXB4 293 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 GAS2L2Q8NHY3 880 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 TSPAN18Q96SJ8 248 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 RBSNQ9H1K0 784 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 KLHL42Q9P2K6 505 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 USP20Q9Y2K6 914 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 TONSLQ96HA7 1378 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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TMOD3-209ENST00000561136 PSAPP07602 524 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 SIX5Q8N196 739 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 PNMA2Q9UL42 364 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 COL15A1P39059 1388 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 CNTNAP1P78357 1384 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 KIF4AO95239 1232 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 RFC4P35249 363 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 DGKZQ13574 1117 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 BEND4Q6ZU67 534 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 MAF1Q9H063 256 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 MUC3BQ9H195 1237 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 PIM2Q9P1W9 311 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 USTQ9Y2C2 406 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF541Q9H0D2 1346 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 LGR5O75473 907 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 RPS6KA4O75676 772 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 MICAL2O94851 1124 aa6.86□□□□□ -1.31
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TMOD3-209ENST00000561136 BMP3P12645 472 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 PAX3P23760 479 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 CDC25BP30305 580 aa6.86□□□□□ -1.31
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TMOD3-209ENST00000561136 NFIXQ14938 502 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF280DQ6N043 979 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 CBLL1Q75N03 491 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 DNAJC10Q8IXB1 793 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 SCN4AP35499 1836 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 KIF24Q5T7B8 1368 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 WASHC2AQ641Q2 1341 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 GLTPD2A6NH11 291 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 MMP20O60882 483 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 XYLBO75191 536 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 OLFM4Q6UX06 510 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 MKL1Q969V6 931 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 POLKQ9UBT6 870 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 SPG7Q9UQ90 795 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 LMNB1P20700 586 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 LBX1P52954 281 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 IGBP1P78318 339 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 SLC39A6Q13433 755 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 OTUD6BQ8N6M0 293 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 PMM1Q92871 262 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-209ENST00000561136 COL26A1Q96A83 441 aa6.84□□□□□ -1.31
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