RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558936.5

RABGGTA-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-207ENST00000558936 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa15□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa15□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 FLRT1Q9NZU1 646 aa15□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa15□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 RIPK3Q9Y572 518 aa15□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 B4E1Z4 1266 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 TTLL1O95922 423 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 PRMT2P55345 433 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 CCL14Q16627 93 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 GPR142Q7Z601 462 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF536O15090 1300 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 RAD50Q92878 1312 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 VWA5AO00534 786 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 FLOT1O75955 427 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 IRF5Q13568 498 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 TTBK2Q6IQ55 1244 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 NPLOC4Q8TAT6 608 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 TRIB2Q92519 343 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 SHISA4Q96DD7 197 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 TSPY2A6NKD2 308 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF213O14771 459 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 COBLO75128 1261 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 KDM4AO75164 1064 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 MCCP23508 829 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 ANTXR2P58335 489 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 SLC35G1Q2M3R5 365 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 SLFN13Q68D06 897 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 SNHG28P0DPA3 235 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 ERCC3P19447 782 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 HOXD10P28358 340 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 SNAP25P60880 206 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 NECTIN1Q15223 517 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 SEC23AQ15436 765 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 KCTD1Q719H9 257 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 ANKS1AQ92625 1134 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 CPVLQ9H3G5 476 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 GOPCQ9HD26 462 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 STX8Q9UNK0 236 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-207ENST00000558936 FRMPD3Q5JV73 1810 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 ADCY3O60266 1144 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 CYP2B6P20813 491 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 PTPREP23469 700 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 GRK4P32298 578 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 GRB14Q14449 540 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 GMCL1Q96IK5 515 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 E7EWF7 191 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 PDHBP11177 359 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 BMP3P12645 472 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 CHST3Q7LGC8 479 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 RASEFQ8IZ41 740 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 PXYLP1Q8TE99 480 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 FGD4Q96M96 766 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 SH2D4AQ9H788 454 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 MCM3APO60318 1980 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 TMEM232C9JQI7 657 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 RAD21O60216 631 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 INHAP05111 366 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 SLC16A2P36021 539 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 NBPF11Q86T75 865 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 RIOX2Q8IUF8 465 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 TRPV1Q8NER1 839 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 RAET1EQ8TD07 263 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 TOMM22Q9NS69 142 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-207ENST00000558936 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms