RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAP3K9P80192 1104 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 SH2D4AQ9H788 454 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-201ENST00000558831 BAG4O95429 457 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 FUT2Q10981 343 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 NBR1Q14596 966 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARMC9Q7Z3E5 817 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 SIAH1Q8IUQ4 282 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 LZTS2Q9BRK4 669 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 GJB4Q9NTQ9 266 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 CSADQ9Y600 493 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC96Q2M329 555 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 ASPRV1Q53RT3 343 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF408Q9H9D4 720 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPCPD1Q9NPB8 672 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 AS3MTQ9HBK9 375 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAP3K11Q16584 847 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLFN13Q68D06 897 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 GOPCQ9HD26 462 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 F5H6K3 240 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 SNHG28P0DPA3 235 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 XBP1P17861 261 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTPRAP18433 802 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 MCM4P33991 863 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC1A4P43007 532 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 KLRC3Q07444 240 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 VGLL4Q14135 290 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRT40Q6A162 431 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHAMP1Q96JM3 812 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBA5Q9GZZ9 404 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 CPVLQ9H3G5 476 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 VAT1LQ9HCJ6 419 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMX2Q9Y320 296 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A1W2PRG0 241 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 GOLGA6L22H0YM25 854 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 ECE1P42892 770 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF543Q08ER8 600 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 PKN1Q16512 942 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLEC17AQ6ZS10 378 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCTD1Q719H9 257 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACER1Q8TDN7 264 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 FEZ1Q99689 392 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 FKBP1BP68106 108 aa19.91■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 DCAF4Q8WV16 495 aa19.91■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZHX2Q9Y6X8 837 aa19.91■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 OTOFQ9HC10 1997 aa19.91■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYTH3O43739 400 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 CELF2O95319 508 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 NCLP19338 710 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 MOB2Q70IA6 237 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 WDR18Q9BV38 432 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPZ1Q9BXG8 430 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 SCG2P13521 617 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 SMARCA1P28370 1054 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 RESTQ13127 1097 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 HOMER1Q86YM7 354 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 C2orf69Q8N8R5 385 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF280CQ8ND82 737 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 VPS54Q9P1Q0 977 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCNJ14Q9UNX9 436 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-201ENST00000558831 UNCXA6NJT0 531 aa19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP17L10C9JJH3 530 aa19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIF3CO14782 793 aa19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-201ENST00000558831 NDUFB10O96000 172 aa19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP14P54578 494 aa19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-201ENST00000558831 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-201ENST00000558831 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-201ENST00000558831 TTBK2Q6IQ55 1244 aa19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM173BQ6P4H8 233 aa19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPICE1Q8N0Z3 855 aa19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-201ENST00000558831 RGS22Q8NE09 1264 aa19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-201ENST00000558831 GMCL1Q96IK5 515 aa19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-201ENST00000558831 VCPKMTQ9H867 229 aa19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-201ENST00000558831 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-201ENST00000558831 DDX11L8A8MPP1 907 aa19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-201ENST00000558831 YY1P25490 414 aa19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms