RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558659.5

CCDC33-205, Transcript of coiled-coil domain containing 33, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCDC33, Length 2,119 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33-205ENST00000558659 CYTH3O43739 400 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 SNHG28P0DPA3 235 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 RTN1Q16799 776 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 WDR18Q9BV38 432 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 VCPKMTQ9H867 229 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 SLC1A4P43007 532 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 MCM2P49736 904 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 GRM1Q13255 1194 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 CUL4AQ13619 759 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 ERO1BQ86YB8 467 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 AIFM3Q96NN9 605 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 ZIC5Q96T25 663 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 KLRF2D3W0D1 207 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 RRP9O43818 475 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 PEX10O60683 326 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 DDAH1O94760 285 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 NT5C2P49902 561 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 ZNF543Q08ER8 600 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 FUT2Q10981 343 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 GRM4Q14833 912 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 CCDC96Q2M329 555 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 TREML2Q5T2D2 321 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC33-205ENST00000558659 FDPSP14324 419 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 VCAM1P19320 739 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 FOSBP53539 338 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 FKBP1BP68106 108 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 PPATQ06203 517 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 TMEM232C9JQI7 657 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 MOGSQ13724 837 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 WNK4Q96J92 1243 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 BMP3P12645 472 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 BECN1Q14457 450 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 AS3MTQ9HBK9 375 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 PTPDC1A2A3K4 754 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 CPLX1O14810 134 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 GOPCQ9HD26 462 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 GINM1Q9NU53 330 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 TLL2Q9Y6L7 1015 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 FSTL1Q12841 308 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 PPIL2Q13356 520 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 SPRYD7Q5W111 196 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 GADL1Q6ZQY3 521 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 HOMER1Q86YM7 354 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 SHISA4Q96DD7 197 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 GMCL1Q96IK5 515 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 GJB2P29033 226 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 PKP1Q13835 747 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 CYP4F22Q6NT55 531 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 RASAL3Q86YV0 1011 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 KIFC2Q96AC6 838 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 KCNH4Q9UQ05 1017 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 CALM1P0DP23 149 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 CALM2P0DP24 149 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 CALM3P0DP25 149 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 RGMBQ6NW40 437 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 DCAF4Q8WV16 495 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 PIGSQ96S52 555 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 PTPN18Q99952 460 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 NID2Q14112 1375 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 IFNAR1P17181 557 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 PKN1Q16512 942 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CCDC33-205ENST00000558659 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms