RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557477.1

PRPF39-212, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF39, Length 724 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-212ENST00000557477 GP6Q9HCN6 339 aa6.81□□□□□ -1.32
PRPF39-212ENST00000557477 U3KQE9 123 aa6.81□□□□□ -1.32
PRPF39-212ENST00000557477 A0A1W2PQU0 124 aa6.8□□□□□ -1.32
PRPF39-212ENST00000557477 TBX1O43435 398 aa6.8□□□□□ -1.32
PRPF39-212ENST00000557477 ITGAVP06756 1048 aa6.8□□□□□ -1.32
PRPF39-212ENST00000557477 NAT2P11245 290 aa6.8□□□□□ -1.32
PRPF39-212ENST00000557477 CYP7A1P22680 504 aa6.8□□□□□ -1.32
PRPF39-212ENST00000557477 HSD3B2P26439 372 aa6.8□□□□□ -1.32
PRPF39-212ENST00000557477 CANXP27824 592 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF445P59923 1031 aa6.8□□□□□ -1.32
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PRPF39-212ENST00000557477 TMEM260Q9NX78 707 aa6.8□□□□□ -1.32
PRPF39-212ENST00000557477 WHRNQ9P202 907 aa6.8□□□□□ -1.32
PRPF39-212ENST00000557477 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.8□□□□□ -1.32
PRPF39-212ENST00000557477 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.8□□□□□ -1.32
PRPF39-212ENST00000557477 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.79□□□□□ -1.32
PRPF39-212ENST00000557477 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PRPF39-212ENST00000557477 CDC45O75419 566 aa6.79□□□□□ -1.32
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PRPF39-212ENST00000557477 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.79□□□□□ -1.32
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PRPF39-212ENST00000557477 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.79□□□□□ -1.32
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PRPF39-212ENST00000557477 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.79□□□□□ -1.32
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PRPF39-212ENST00000557477 IGHA1P01876 353 aa6.78□□□□□ -1.32
PRPF39-212ENST00000557477 PPP2R2AP63151 447 aa6.78□□□□□ -1.32
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PRPF39-212ENST00000557477 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PRPF39-212ENST00000557477 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.78□□□□□ -1.32
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PRPF39-212ENST00000557477 FAM181AQ8N9Y4 354 aa6.78□□□□□ -1.32
PRPF39-212ENST00000557477 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
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PRPF39-212ENST00000557477 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PRPF39-212ENST00000557477 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.78□□□□□ -1.32
PRPF39-212ENST00000557477 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.78□□□□□ -1.32
PRPF39-212ENST00000557477 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa6.78□□□□□ -1.32
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PRPF39-212ENST00000557477 BVESQ8NE79 360 aa6.77□□□□□ -1.33
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PRPF39-212ENST00000557477 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PRPF39-212ENST00000557477 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.77□□□□□ -1.33
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PRPF39-212ENST00000557477 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PRPF39-212ENST00000557477 PPP2R5DQ14738 602 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF39-212ENST00000557477 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
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PRPF39-212ENST00000557477 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.76□□□□□ -1.33
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PRPF39-212ENST00000557477 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF39-212ENST00000557477 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF39-212ENST00000557477 AKT3Q9Y243 479 aa6.76□□□□□ -1.33
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PRPF39-212ENST00000557477 A0A087WZG4 1122 aa6.75□□□□□ -1.33
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PRPF39-212ENST00000557477 WDR64B1ANS9 1081 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF39-212ENST00000557477 MEIS1O00470 390 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF39-212ENST00000557477 SIGLEC6O43699 453 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF39-212ENST00000557477 FURINP09958 794 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF39-212ENST00000557477 ITIH2P19823 946 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF39-212ENST00000557477 L1CAMP32004 1257 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF39-212ENST00000557477 OXCT1P55809 520 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF39-212ENST00000557477 CYP27A1Q02318 531 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF39-212ENST00000557477 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PRPF39-212ENST00000557477 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.75□□□□□ -1.33
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