RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RFX7Q2KHR2 1363 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAD50Q92878 1312 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DOCK2Q92608 1830 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A0G2JLW4 131 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SNAP23O00161 211 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IDH1O75874 414 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MCAMP43121 646 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZAP70P43403 619 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC93Q567U6 631 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRIM50Q86XT4 487 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TBC1D16Q8TBP0 767 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C22orf23Q9BZE7 217 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANO2Q9NQ90 1003 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HELLSQ9NRZ9 838 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.7□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYH2Q9UKX2 1941 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MED23Q9ULK4 1368 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CLGNO14967 610 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 INHAP05111 366 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DPEP1P16444 411 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CENPCQ03188 943 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TLR1Q15399 786 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ILDR2Q71H61 639 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PODNQ7Z5L7 613 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAI14Q9P0K7 980 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HMG20BQ9P0W2 317 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABCF2Q9UG63 623 aa6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COL4A1P02462 1669 aa6.68□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC35F4A4IF30 521 aa6.68□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C21orf2O43822 256 aa6.68□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RHOQP17081 205 aa6.68□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATP1A2P50993 1020 aa6.68□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RASGRF1Q13972 1273 aa6.68□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa6.68□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.68□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa6.68□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COA1Q9GZY4 146 aa6.68□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VPS33BQ9H267 617 aa6.68□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POLLQ9UGP5 575 aa6.68□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa6.68□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SGSM2O43147 1006 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LDHCP07864 332 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MMP14P50281 582 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GSTO1P78417 241 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMTC2Q8N394 836 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AIDAQ96BJ3 306 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CD209Q9NNX6 404 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DUOX1Q9NRD9 1551 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IL1R1P14778 569 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADD2P35612 726 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POU4F2Q12837 409 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BECN1Q14457 450 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UBE3CQ15386 1083 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 APPBP2Q92624 585 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP26Q9BXU7 913 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANTXR1Q9H6X2 564 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC171Q6TFL3 1326 aa6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAST2Q6P0Q8 1798 aa6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPIP5K2O43314 1243 aa6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GNAT2P19087 354 aa6.66□□□□□ -1.34
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CYP7A1P22680 504 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 203.3 ms