RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534486.1

KDM2A-215, Transcript of lysine demethylase 2A, humanhuman

TSL 3

Gene KDM2A, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2A-215ENST00000534486 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.16□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 PHF20Q9BVI0 1012 aa7.16□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.16□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 CNNM1Q9NRU3 951 aa7.16□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 MYO1AQ9UBC5 1043 aa7.16□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 RAB21Q9UL25 225 aa7.16□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 ZNF804BA4D1E1 1349 aa7.16□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 CHD4Q14839 1912 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 TRIM75PA6NK02 468 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 TULP2O00295 520 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 TUBBP07437 444 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 TXLNAP40222 546 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 TRAPPC10P48553 1259 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 GNG11P61952 73 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 TRIM14Q14142 442 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 WTAPQ15007 396 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 ISM2Q6H9L7 571 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 MFSD6Q6ZSS7 791 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 CNGA4Q8IV77 575 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 ZNF654Q8IZM8 581 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 MAGEB6Q8N7X4 407 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 CEP112Q8N8E3 955 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 IQUBQ8NA54 791 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 FANCBQ8NB91 859 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 SHISA4Q96DD7 197 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 FUT8Q9BYC5 575 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 NACAP1Q9BZK3 213 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 CSRNP2Q9H175 543 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 ST7Q9NRC1 585 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa7.15□□□□□ -1.26
KDM2A-215ENST00000534486 SCN7AQ01118 1682 aa7.15□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 UBE2Q2LH0YL09 131 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 DDAH1O94760 285 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 APPP05067 770 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 ITGB4P16144 1822 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 CTDSPL2Q05D32 466 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 SPAG1Q07617 926 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 PPARAQ07869 468 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 NPY5RQ15761 445 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 PKN1Q16512 942 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 TEX35Q5T0J7 233 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 RAD9BQ6WBX8 426 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 SYNE4Q8N205 404 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 LCORLQ8N3X6 602 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 DHX58Q96C10 678 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 PAGE5Q96GU1 130 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 MYL10Q9BUA6 226 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 BRIP1Q9BX63 1249 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 WNK3Q9BYP7 1800 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 ARMT1Q9H993 441 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 ARFGAP3Q9NP61 516 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 CDC23Q9UJX2 597 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 ASAP1Q9ULH1 1129 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 KCNJ14Q9UNX9 436 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 A0A087X0B3 334 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 ERICH2A1L162 156 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 KIF5CO60282 957 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 IGSF3O75054 1194 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 RPS6KA5O75582 802 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 GYPCP04921 128 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 CALM1P0DP23 149 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 CALM2P0DP24 149 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 CALM3P0DP25 149 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 XBP1P17861 261 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 OAS2P29728 719 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 KRT2P35908 639 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 TDO2P48775 406 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 AMPD2Q01433 879 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 GOLGA8FQ08AF8 430 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 NR5A1Q13285 461 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 ZNF827Q17R98 1081 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 PARP10Q53GL7 1025 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 TMTC3Q6ZXV5 915 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 TMTC1Q8IUR5 882 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM2A-215ENST00000534486 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.9 ms