RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530513.5

PACSIN3-207, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-207ENST00000530513 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
PACSIN3-207ENST00000530513 FBXO28Q9NVF7 368 aa26.89■■□□□ 1.9
PACSIN3-207ENST00000530513 A0A0C4DFX4 3053 aa26.89■■□□□ 1.9
PACSIN3-207ENST00000530513 ABRAQ8N0Z2 381 aa26.88■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.88■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 UNC80Q8N2C7 3258 aa26.87■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 SMCHD1A6NHR9 2005 aa26.87■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 SEPT4O43236 478 aa26.87■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 RTP1P59025 263 aa26.87■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa26.87■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 MAML3Q96JK9 1138 aa26.87■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa26.86■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC17A8Q8NDX2 589 aa26.86■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa26.86■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 FCER1AP12319 257 aa26.85■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 KANSL2Q9H9L4 492 aa26.85■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC5A4Q9NY91 659 aa26.85■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 KBTBD13C9JR72 458 aa26.84■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 FAM83BQ5T0W9 1011 aa26.84■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 ARRDC4Q8NCT1 418 aa26.84■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa26.84■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 ROBO3Q96MS0 1386 aa26.84■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 EYSQ5T1H1 3165 aa26.83■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC25A27O95847 323 aa26.83■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 FAM47AQ5JRC9 791 aa26.83■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 MMP19Q99542 508 aa26.83■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 GOPCQ9HD26 462 aa26.83■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 ECHDC1Q9NTX5 307 aa26.83■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa26.83■■□□□ 1.89
PACSIN3-207ENST00000530513 VWA5AO00534 786 aa26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 RAD21O60216 631 aa26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 PGK2P07205 417 aa26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 TSHZ3Q63HK5 1081 aa26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 RIOX2Q8IUF8 465 aa26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 REPS2Q8NFH8 660 aa26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 MTMR10Q9NXD2 777 aa26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa26.81■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 STK11IPQ8N1F8 1099 aa26.81■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 CDH23Q9H251 3354 aa26.8■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 GSG1L2A8MUP6 293 aa26.8■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 RASA1P20936 1047 aa26.8■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 SNX17Q15036 470 aa26.8■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 LRRC41Q15345 812 aa26.8■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 TRIM60Q495X7 471 aa26.8■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 KBTBD3Q8NAB2 608 aa26.8■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa26.8■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 ADCYAP1R1P41586 468 aa26.79■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 SBK1Q52WX2 424 aa26.79■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 OSBP2Q969R2 916 aa26.79■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa26.79■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 STAT3P40763 770 aa26.78■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 KCTD2Q14681 263 aa26.78■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF792Q3KQV3 632 aa26.78■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 APPBP2Q92624 585 aa26.78■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 FERMT2Q96AC1 680 aa26.78■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 MCM3APO60318 1980 aa26.78■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 TINF2Q9BSI4 451 aa26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3-207ENST00000530513 MINDY4BA8MYZ0 360 aa26.76■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 SLF1Q9BQI6 1058 aa26.76■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa26.76■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 PDLIM7Q9NR12 457 aa26.76■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 NRBP1Q9UHY1 535 aa26.76■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 M0R2C6 588 aa26.75■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 DLL1O00548 723 aa26.75■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 GPAA1O43292 621 aa26.75■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 NDUFB10O96000 172 aa26.75■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 GIMAP6Q6P9H5 292 aa26.75■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 GPATCH3Q96I76 525 aa26.75■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 DCTPP1Q9H773 170 aa26.75■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.75■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 RARBP10826 455 aa26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 COPB2P35606 906 aa26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 TEX13BQ9BXU2 312 aa26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 NYAP2Q9P242 653 aa26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 PHF24Q9UPV7 400 aa26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 F5H6K3 240 aa26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 PGK1P00558 417 aa26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 KLRC3Q07444 240 aa26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 RIPK3Q9Y572 518 aa26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 POTEB2H3BUK9 544 aa26.72■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 PRDM1O75626 825 aa26.72■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 TDO2P48775 406 aa26.72■■□□□ 1.87
PACSIN3-207ENST00000530513 C9orf50Q5SZB4 431 aa26.72■■□□□ 1.87
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