RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 TNNI2P48788 182 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 FUT2Q10981 343 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 USH1GQ495M9 461 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 GJA10Q969M2 543 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 PDLIM2Q96JY6 352 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 PHF20Q9BVI0 1012 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 IFNKQ9P0W0 207 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 CFAP100Q494V2 611 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 TTLL6Q8N841 843 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 GJA3Q9Y6H8 435 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 FAM205AQ6ZU69 1335 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 PCP11498 1178 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 SEPT2Q15019 361 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 STK36Q9NRP7 1315 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 KRBA2Q6ZNG9 492 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 C16orf86Q6ZW13 317 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 CSRNP1Q96S65 589 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 TOP1P11387 765 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 TXKP42681 527 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 GNAQP50148 359 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 KARSQ15046 597 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 PPP2R5BQ15173 497 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 UBE2SQ16763 222 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 NEDD1Q8NHV4 660 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 SMARCE1Q969G3 411 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRK-216ENST00000524481 PPP6R2O75170 966 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 CLCN1P35523 988 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 SLC1A4P43007 532 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 TPM4P67936 248 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 ERCC3P19447 782 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 PTPREP23469 700 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 GOLGA8FQ08AF8 430 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 TMC4Q7Z404 712 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 TMOD2Q9NZR1 351 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 UBA7P41226 1012 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF75DP51815 510 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 POSTNQ15063 836 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 SLC35G1Q2M3R5 365 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 RESP18Q5W5W9 173 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 TMC6Q7Z403 805 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 CAMKK2Q96RR4 588 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 MTMR4Q9NYA4 1195 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 FANCLQ9NW38 375 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 PYCARDQ9ULZ3 195 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 USP17L10C9JJH3 530 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 GH2P01242 217 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 FGRP09769 529 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 CALML3P27482 149 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 TECP42680 631 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 DLGAP5Q15398 846 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 CPLX3Q8WVH0 158 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 NHSQ6T4R5 1651 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 EEF2P13639 858 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 PRKG1Q13976 671 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 GRM4Q14833 912 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 CDAN1Q8IWY9 1227 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 A0A087X0B3 334 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 SHTN1A0MZ66 631 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 PSMD14O00487 310 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 TTLL1O95922 423 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 IQCB1Q15051 598 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 DACT2Q5SW24 774 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 DTHD1Q6ZMT9 781 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM60Q9H2L4 133 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 C6orf50Q9HD87 102 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 PCDHA4Q9UN74 947 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 CACNA1SQ13698 1873 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 YDJCA8MPS7 323 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 USP17L15C9J2P7 530 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 USP17L13C9JLJ4 530 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 USP17L11C9JVI0 530 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 USP17L18D6R9N7 530 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 USP17L22D6RA61 530 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 USP17L17D6RBQ6 530 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 USP17L19D6RCP7 530 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 USP17L20D6RJB6 530 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-216ENST00000524481 PDHBP11177 359 aa13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms