RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 PIBF1Q8WXW3 757 aa26.51■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 SNHG28P0DPA3 235 aa26.5■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC35G1Q2M3R5 365 aa26.5■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa26.49■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 JAK2O60674 1132 aa26.49■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 CTDNEP1O95476 244 aa26.49■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 CALM1P0DP23 149 aa26.49■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 CALM2P0DP24 149 aa26.49■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 CALM3P0DP25 149 aa26.49■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 VCAM1P19320 739 aa26.49■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF543Q08ER8 600 aa26.49■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 RGMBQ6NW40 437 aa26.49■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 BMP3P12645 472 aa26.48■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 BECN1Q14457 450 aa26.48■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 SPRYD7Q5W111 196 aa26.48■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 GADL1Q6ZQY3 521 aa26.48■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
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TSNARE1-208ENST00000524325 IL27Q8NEV9 243 aa26.48■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 PHKBQ93100 1093 aa26.48■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 FBXO28Q9NVF7 368 aa26.48■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 UNCXA6NJT0 531 aa26.47■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 KLRF2D3W0D1 207 aa26.47■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 TREML2Q5T2D2 321 aa26.47■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 GMCL1Q96IK5 515 aa26.47■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNH4Q9UQ05 1017 aa26.47■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM232C9JQI7 657 aa26.47■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 APLP1P51693 650 aa26.47■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 USP14P54578 494 aa26.47■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 DCAF4Q8WV16 495 aa26.47■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 VAT1LQ9HCJ6 419 aa26.47■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 TMOD4Q9NZQ9 345 aa26.47■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 C19orf81C9J6K1 198 aa26.46■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 CPLX1O14810 134 aa26.46■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 SNAP25P60880 206 aa26.46■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 TMTC3Q6ZXV5 915 aa26.46■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX11Q96FC9 970 aa26.46■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa26.46■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 TRPM7Q96QT4 1865 aa26.46■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 CXCL11O14625 94 aa26.46■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 KIF5BP33176 963 aa26.46■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 IKQ13123 557 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 NTRK3Q16288 839 aa26.46■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 TANGO6Q9C0B7 1094 aa26.46■■□□□ 1.83
TSNARE1-208ENST00000524325 MYH4Q9Y623 1939 aa26.45■■□□□ 1.82
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TSNARE1-208ENST00000524325 ASPRV1Q53RT3 343 aa26.44■■□□□ 1.82
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TSNARE1-208ENST00000524325 MS4A4AQ96JQ5 239 aa26.44■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 PHIPQ8WWQ0 1821 aa26.44■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 FUT2Q10981 343 aa26.44■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 ZIC5Q96T25 663 aa26.44■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 MAP3K14Q99558 947 aa26.44■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 NID2Q14112 1375 aa26.44■■□□□ 1.82
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TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.42■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 PTPDC1A2A3K4 754 aa26.42■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 KIFC2Q96AC6 838 aa26.42■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 C12orf42Q96LP6 360 aa26.42■■□□□ 1.82
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TSNARE1-208ENST00000524325 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR46O15213 610 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
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TSNARE1-208ENST00000524325 V9GY48 417 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa26.41■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC10A3P09131 477 aa26.41■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 CCL15Q16663 113 aa26.41■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 HOMER1Q86YM7 354 aa26.41■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 ADGRF4Q8IZF3 695 aa26.41■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 FLOT1O75955 427 aa26.4■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 IFNAR1P17181 557 aa26.4■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 STAT2P52630 851 aa26.4■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 GTF2A2P52657 109 aa26.4■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 FOSBP53539 338 aa26.4■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 GPAT2Q6NUI2 795 aa26.4■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 AIFM3Q96NN9 605 aa26.4■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa26.4■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 FDPSP14324 419 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
TSNARE1-208ENST00000524325 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
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