RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523555.5

PABPC1-222, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 3

Gene PABPC1, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-222	ENST00000523555	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	CCL5	P13501	91 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	CCL14	Q16627	93 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	MORN1	Q5T089	497 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	REPS2	Q8NFH8	660 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	MKL1	Q969V6	931 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	GOPC	Q9HD26	462 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	ALPK3	Q96L96	1907 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	TSPY2	A6NKD2	308 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	ORC4	O43929	436 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	TTLL1	O95922	423 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	CHML	P26374	656 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	MAPK4	P31152	587 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	WDR78	Q5VTH9	848 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	LCT	P09848	1927 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	MCM3AP	O60318	1980 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	HIP1	O00291	1037 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	ERCC3	P19447	782 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	PTPRE	P23469	700 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	NOV	P48745	357 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	PTH1R	Q03431	593 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	PLS1	Q14651	629 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	SLFN13	Q68D06	897 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	RNF208	Q9H0X6	261 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	TOMM22	Q9NS69	142 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	STX8	Q9UNK0	236 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PABPC1-222	ENST00000523555	VWA5A	O00534	786 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	UBXN2A	P68543	259 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	MAP2K5	Q13163	448 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	GRB14	Q14449	540 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	MTMR7	Q9Y216	660 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	RIPK3	Q9Y572	518 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF213	O14771	459 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	COBL	O75128	1261 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	HMGCR	P04035	888 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	BMP3	P12645	472 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	MCC	P23508	829 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	GJA8	P48165	433 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	CCNA1	P78396	465 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	KCTD1	Q719H9	257 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	MB21D1	Q8N884	522 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	KIFC2	Q96AC6	838 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	APBA2	Q99767	749 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	MYH6	P13533	1939 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555		B4E1Z4	1266 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM232	C9JQI7	657 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	SGSM2	O43147	1006 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	IGHA2	P01877	340 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	GJB1	P08034	283 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	ADORA2A	P29274	412 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	RGS2	P41220	211 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	SNAP25	P60880	206 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	DEFB118	Q96PH6	123 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PABPC1-222	ENST00000523555	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	11.25	□□□□□ -0.61	2e-7	■■■□□ 16.8
PABPC1-222	ENST00000523555	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61

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