RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	SEMA7A	O75326	666 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	GART	P22102	1010 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	LTK	P29376	864 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	PDE6B	P35913	854 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	GJA8	P48165	433 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	PWP1	Q13610	501 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702		Q96M66	194 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702		F6X3S4	739 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	SEPT6	Q14141	434 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	SNX17	Q15036	470 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	NR0B2	Q15466	257 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	MAP3K11	Q16584	847 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	RELL1	Q8IUW5	271 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	GML	Q99445	158 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	SP110	Q9HB58	689 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	CAPN10	Q9HC96	672 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
FAM49B-222	ENST00000522702	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	RFXAP	O00287	272 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	5.77	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	CHRNE	Q04844	493 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	PAK2	Q13177	524 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	KCTD3	Q9Y597	815 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	GREM1	O60565	184 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	PF4	P02776	101 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	LMNB2	Q03252	620 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	DUSP4	Q13115	394 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	SPON2	Q9BUD6	331 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	GPR160	Q9UJ42	338 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	ATP2B1	P20020	1258 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	SGPP1	Q9BX95	441 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	LNPK	Q9C0E8	428 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	FGR	P09769	529 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	SYN1	P17600	705 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	GPRASP2	Q96D09	838 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	LRRN2	O75325	713 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	SASH1	O94885	1247 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	PLCG1	P19174	1290 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	CRK	P46108	304 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	NFIX	Q14938	502 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FAM49B-222	ENST00000522702	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms