RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 IKBKEQ14164 716 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 SLC43A3Q8NBI5 491 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 TMEM74Q96NL1 305 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 CHMP4AQ9BY43 222 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 ACBD3Q9H3P7 528 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 COPRSQ9NQ92 184 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 IFT57Q9NWB7 429 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 H3BRJ5 948 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 M0R082 166 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 LIG3P49916 1009 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 RPS26P62854 115 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 TEFQ10587 303 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 IL22RA1Q8N6P7 574 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 ZNF417Q8TAU3 575 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 WNT8BQ93098 351 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 TINF2Q9BSI4 451 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 BABAM1Q9NWV8 329 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 PPME1Q9Y570 386 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 ITGB4P16144 1822 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 WFS1O76024 890 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 EPHA1P21709 976 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 POLD1P28340 1107 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 GMPRP36959 345 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 CAPN10Q9HC96 672 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 KIF13BQ9NQT8 1826 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 NME2P22392 152 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 DUSP27Q5VZP5 1158 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 TTBK2Q6IQ55 1244 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 AGMOQ6ZNB7 445 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 MCM10Q7L590 875 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 PHC3Q8NDX5 983 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 DCAF5Q96JK2 942 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 RCAN3Q9UKA8 241 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa9.27□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 SHISA8B8ZZ34 492 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 RNMTO43148 476 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 GRIN3BO60391 1043 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 PHKG2P15735 406 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 ARL4DP49703 201 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 DCTN1Q14203 1278 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 MAP3K11Q16584 847 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 PCNX4Q63HM2 1172 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 MSL1Q68DK7 614 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 LYPD4Q6UWN0 246 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 WFDC8Q8IUA0 241 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 RHOVQ96L33 236 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 OSGEPQ9NPF4 335 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 KCNQ5Q9NR82 932 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 TSPYL4Q9UJ04 414 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 CYP8B1Q9UNU6 501 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 MINDY4BA8MYZ0 360 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 PAGE1O75459 146 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 AMPD1P23109 780 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 LMNB2Q03252 620 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 LRRC14Q15048 493 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 SPON2Q9BUD6 331 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 FANCIQ9NVI1 1328 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 C4BP0C0L5 1744 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 PKD1L3Q7Z443 1732 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 BTBD11A6QL63 1104 aa9.24□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 ERVV-2B6SEH9 535 aa9.24□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 CHL1O00533 1208 aa9.24□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 ZNF853P0CG23 659 aa9.24□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 BMP6P22004 513 aa9.24□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 GJA8P48165 433 aa9.24□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 TNNI2P48788 182 aa9.24□□□□□ -0.93
HERC3-210ENST00000512194 AP3B2Q13367 1082 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms