RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-208ENST00000512193 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.96□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 KIF4AO95239 1232 aa8.96□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 SIK1P57059 783 aa8.96□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 RBL2Q08999 1139 aa8.96□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa8.96□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 HAUS3Q68CZ6 603 aa8.96□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 CCDC50Q8IVM0 306 aa8.96□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 IFT20Q8IY31 132 aa8.96□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 LZTS2Q9BRK4 669 aa8.96□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.96□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 HAUS4Q9H6D7 363 aa8.96□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 CDC23Q9UJX2 597 aa8.96□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa8.96□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 GTF2IP78347 998 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 RASGRF1Q13972 1273 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 VWA3BQ502W6 1294 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 OR52Z1P0C646 297 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 SLFN14P0C7P3 912 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 ACTN2P35609 894 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 SFMBT2Q5VUG0 894 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 GSTA5Q7RTV2 222 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 CCDC26Q8TAB7 109 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 RABGGTAQ92696 567 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 DNM3Q9UQ16 869 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 CRKLP46109 303 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 RPS6KA1Q15418 735 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 PPP1R7Q15435 360 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 CFAP221Q4G0U5 840 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 RDH13Q8NBN7 331 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 CCDC77Q9BR77 488 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 PDE11AQ9HCR9 933 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 KCNK9Q9NPC2 374 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 E9PCH4 1651 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 BUB1O43683 1085 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 SPOPO43791 374 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 NEBLO76041 1014 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 CALCOCO2Q13137 446 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 HLFQ16534 295 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 NEK8Q86SG6 692 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 VSTM4Q8IW00 320 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 ACRBPQ8NEB7 543 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 FAM212AQ96EL1 285 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 SYNCQ9H7C4 482 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 HDAC9Q9UKV0 1011 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 TAF6LQ9Y6J9 622 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 ALKQ9UM73 1620 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 ZMYND10O75800 440 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 CASP1P29466 404 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 LIFRP42702 1097 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 STOX1Q6ZVD7 989 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 DAAM2Q86T65 1068 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 TBC1D10CQ8IV04 446 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 PIGBQ92521 554 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 IKBKGQ9Y6K9 419 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 CHD1O14646 1710 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 WDR17Q8IZU2 1322 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 B4DLN1 442 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 GCNT3O95395 438 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 CFBP00751 764 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 GUCY2FP51841 1108 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 MYOCDQ8IZQ8 938 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 PCDHA12Q9UN75 941 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 CRB1P82279 1406 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 ATP10DQ9P241 1426 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 USP27XA6NNY8 438 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 DDAH1O94760 285 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 CLCN6P51797 869 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 LONRF2Q1L5Z9 754 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 SARM1Q6SZW1 724 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 TRIM58Q8NG06 486 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 MTUS1Q9ULD2 1270 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 CFAP74Q9C0B2 1584 aa8.93□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 CROCC2H7BZ55 1655 aa8.93□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 LONP1P36776 959 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 PAK2Q13177 524 aa8.93□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 PEX26Q7Z412 305 aa8.93□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 MYCT1Q8N699 235 aa8.93□□□□□ -0.98
NEK1-208ENST00000512193 ANKS4BQ8N8V4 417 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 548.2 ms