RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 ASPRV1Q53RT3 343 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 RILPL1Q5EBL4 403 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 TMEM179Q6ZVK1 233 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 BRMS1Q9HCU9 246 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 SEPT2Q15019 361 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 DPF2Q92785 391 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP29.96■■■□□ 2.399e-6■■□□□ 14.5
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HOXB3-212ENST00000498678 MKL1Q969V6 931 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 NR1I2O75469 434 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 GDF11O95390 407 aa29.96■■■□□ 2.39
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HOXB3-212ENST00000498678 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
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HOXB3-212ENST00000498678 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-212ENST00000498678 GRPEL1Q9HAV7 217 aa29.96■■■□□ 2.39
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HOXB3-212ENST00000498678 JAG1P78504 1218 aa29.95■■■□□ 2.38
HOXB3-212ENST00000498678 TMEM39BQ9GZU3 492 aa29.95■■■□□ 2.38
HOXB3-212ENST00000498678 RIOX1Q9H6W3 641 aa29.95■■■□□ 2.38
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HOXB3-212ENST00000498678 WWC2Q6AWC2 1192 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-212ENST00000498678 UBA5Q9GZZ9 404 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-212ENST00000498678 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa29.94■■■□□ 2.38
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HOXB3-212ENST00000498678 A0A1W2PQ64 194 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-212ENST00000498678 A0A1W2PQD8 194 aa29.94■■■□□ 2.38
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HOXB3-212ENST00000498678 TYW1BQ6NUM6 668 aa29.94■■■□□ 2.38
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HOXB3-212ENST00000498678 ZNF543Q08ER8 600 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXB3-212ENST00000498678 PGAP2Q9UHJ9 254 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXB3-212ENST00000498678 MYH4Q9Y623 1939 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXB3-212ENST00000498678 FAM205CA6NFA0 338 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXB3-212ENST00000498678 PPP6R2O75170 966 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXB3-212ENST00000498678 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP29.93■■■□□ 2.388e-6■■□□□ 12.6
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HOXB3-212ENST00000498678 CDAN1Q8IWY9 1227 aa29.93■■■□□ 2.38
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HOXB3-212ENST00000498678 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
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HOXB3-212ENST00000498678 CALML3P27482 149 aa29.92■■■□□ 2.38
HOXB3-212ENST00000498678 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
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HOXB3-212ENST00000498678 NUP62CLQ9H1M0 184 aa29.92■■■□□ 2.38
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HOXB3-212ENST00000498678 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF541Q9H0D2 1346 aa29.92■■■□□ 2.38
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HOXB3-212ENST00000498678 GPCPD1Q9NPB8 672 aa29.91■■■□□ 2.38
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HOXB3-212ENST00000498678 TBC1D12O60347 775 aa29.9■■■□□ 2.38
HOXB3-212ENST00000498678 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
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HOXB3-212ENST00000498678 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
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HOXB3-212ENST00000498678 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa29.9■■■□□ 2.38
HOXB3-212ENST00000498678 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
HOXB3-212ENST00000498678 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa29.9■■■□□ 2.38
HOXB3-212ENST00000498678 SAMD7Q7Z3H4 446 aa29.9■■■□□ 2.38
HOXB3-212ENST00000498678 HOMER1Q86YM7 354 aa29.9■■■□□ 2.38
HOXB3-212ENST00000498678 BLIDQ8IZY5 108 aa29.9■■■□□ 2.38
HOXB3-212ENST00000498678 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
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HOXB3-212ENST00000498678 PCDHA4Q9UN74 947 aa29.9■■■□□ 2.38
HOXB3-212ENST00000498678 CCDC148Q8NFR7 591 aa29.89■■■□□ 2.38
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HOXB3-212ENST00000498678 FAM160A1Q05DH4 1040 aa29.88■■■□□ 2.37
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HOXB3-212ENST00000498678 TSPY26PQ9H489 355 aa29.88■■■□□ 2.37
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HOXB3-212ENST00000498678 GALNT17Q6IS24 598 aa29.87■■■□□ 2.37
HOXB3-212ENST00000498678 DAGLBQ8NCG7 672 aa29.87■■■□□ 2.37
HOXB3-212ENST00000498678 TNMDQ9H2S6 317 aa29.87■■■□□ 2.37
HOXB3-212ENST00000498678 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
HOXB3-212ENST00000498678 A0A1B0GVL5 298 aa29.86■■■□□ 2.37
HOXB3-212ENST00000498678 CMA1P23946 247 aa29.86■■■□□ 2.37
HOXB3-212ENST00000498678 MAP3K10Q02779 954 aa29.86■■■□□ 2.37
HOXB3-212ENST00000498678 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
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