RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497251.1

TRAPPC3-207, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-207ENST00000497251 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 EVX2Q03828 476 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 KCTD2Q14681 263 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 SNX17Q15036 470 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 CTR9Q6PD62 1173 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 GPATCH3Q96I76 525 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 MYH8P13535 1937 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 A0A0G2JMZ2 1700 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 FRMPD3Q5JV73 1810 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 VWA5AO00534 786 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 STAT3P40763 770 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 RTP1P59025 263 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 MMP19Q99542 508 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 GNAT2P19087 354 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 NYAP2Q9P242 653 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 POTEB2H3BUK9 544 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 RARBP10826 455 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 RNF180Q86T96 592 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 TINF2Q9BSI4 451 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 DLL1O00548 723 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 ATP2A1O14983 1001 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 LRRC41Q15345 812 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 PHF24Q9UPV7 400 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 APPBP2Q92624 585 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 BCL11AQ9H165 835 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 MYH7P12883 1935 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 FDX1P10109 184 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 AKR1A1P14550 325 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 DCTPP1Q9H773 170 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 RASA1P20936 1047 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 ADCYAP1R1P41586 468 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 Q7L0L9 218 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 REPS2Q8NFH8 660 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 MKL1Q969V6 931 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 F5H6K3 240 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 OAZ1P54368 228 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 KLRC3Q07444 240 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 FAM47AQ5JRC9 791 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 FBXO40Q9UH90 709 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 PARP14Q460N5 1801 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZBED4O75132 1171 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 TRIM60Q495X7 471 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 DDX11Q96FC9 970 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 TOX2Q96NM4 488 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 NACAP1Q9BZK3 213 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 FEM1BQ9UK73 627 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 ERC2O15083 957 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 RAD21O60216 631 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 PGK2P07205 417 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 ANO1Q5XXA6 986 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms