RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 GOPCQ9HD26 462 aa27.07■■□□□ 1.92
TRDMT1-211ENST00000495022 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa27.07■■□□□ 1.92
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC25A27O95847 323 aa27.06■■□□□ 1.92
TRDMT1-211ENST00000495022 SBK1Q52WX2 424 aa27.06■■□□□ 1.92
TRDMT1-211ENST00000495022 GPATCH3Q96I76 525 aa27.06■■□□□ 1.92
TRDMT1-211ENST00000495022 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
TRDMT1-211ENST00000495022 A0A0C4DFX4 3053 aa27.06■■□□□ 1.92
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TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM132BQ14DG7 1078 aa27.05■■□□□ 1.92
TRDMT1-211ENST00000495022 GIMAP6Q6P9H5 292 aa27.05■■□□□ 1.92
TRDMT1-211ENST00000495022 KBTBD3Q8NAB2 608 aa27.05■■□□□ 1.92
TRDMT1-211ENST00000495022 DCTPP1Q9H773 170 aa27.05■■□□□ 1.92
TRDMT1-211ENST00000495022 LTBP2Q14767 1821 aa27.04■■□□□ 1.92
TRDMT1-211ENST00000495022 SEPT4O43236 478 aa27.04■■□□□ 1.92
TRDMT1-211ENST00000495022 ARRDC4Q8NCT1 418 aa27.04■■□□□ 1.92
TRDMT1-211ENST00000495022 ROBO3Q96MS0 1386 aa27.03■■□□□ 1.92
TRDMT1-211ENST00000495022 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
TRDMT1-211ENST00000495022 MAML3Q96JK9 1138 aa27.03■■□□□ 1.92
TRDMT1-211ENST00000495022 GSG1L2A8MUP6 293 aa27.02■■□□□ 1.92
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TRDMT1-211ENST00000495022 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP27.02■■□□□ 1.92
TRDMT1-211ENST00000495022 FBXO28Q9NVF7 368 aa27.02■■□□□ 1.92
TRDMT1-211ENST00000495022 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa27.02■■□□□ 1.92
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TRDMT1-211ENST00000495022 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
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TRDMT1-211ENST00000495022 KBTBD13C9JR72 458 aa27■■□□□ 1.91
TRDMT1-211ENST00000495022 RASA1P20936 1047 aa27■■□□□ 1.91
TRDMT1-211ENST00000495022 COPB2P35606 906 aa27■■□□□ 1.91
TRDMT1-211ENST00000495022 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
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TRDMT1-211ENST00000495022 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
TRDMT1-211ENST00000495022 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM83BQ5T0W9 1011 aa26.99■■□□□ 1.91
TRDMT1-211ENST00000495022 MMP19Q99542 508 aa26.99■■□□□ 1.91
TRDMT1-211ENST00000495022 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.99■■□□□ 1.91
TRDMT1-211ENST00000495022 NYAP2Q9P242 653 aa26.99■■□□□ 1.91
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
TRDMT1-211ENST00000495022 GNAT2P19087 354 aa26.98■■□□□ 1.91
TRDMT1-211ENST00000495022 RTP1P59025 263 aa26.98■■□□□ 1.91
TRDMT1-211ENST00000495022 REPS2Q8NFH8 660 aa26.98■■□□□ 1.91
TRDMT1-211ENST00000495022 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
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TRDMT1-211ENST00000495022 RAD21O60216 631 aa26.97■■□□□ 1.91
TRDMT1-211ENST00000495022 KCTD2Q14681 263 aa26.97■■□□□ 1.91
TRDMT1-211ENST00000495022 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa26.97■■□□□ 1.91
TRDMT1-211ENST00000495022 ANO1Q5XXA6 986 aa26.97■■□□□ 1.91
TRDMT1-211ENST00000495022 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
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TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF287Q9HBT7 754 aa26.97■■□□□ 1.91
TRDMT1-211ENST00000495022 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
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TRDMT1-211ENST00000495022 TINF2Q9BSI4 451 aa26.96■■□□□ 1.91
TRDMT1-211ENST00000495022 TTC41PQ6P2S7 1318 aa26.95■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 SNX17Q15036 470 aa26.95■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRC41Q15345 812 aa26.95■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF792Q3KQV3 632 aa26.95■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa26.94■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 F5H6K3 240 aa26.94■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 PGK2P07205 417 aa26.94■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 TDO2P48775 406 aa26.94■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 KLRC3Q07444 240 aa26.94■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM47AQ5JRC9 791 aa26.94■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 STK11IPQ8N1F8 1099 aa26.94■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 TEX13BQ9BXU2 312 aa26.94■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa26.94■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 M0R2C6 588 aa26.93■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 NDUFB10O96000 172 aa26.93■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
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TRDMT1-211ENST00000495022 RARBP10826 455 aa26.92■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 C1orf53Q5VUE5 145 aa26.92■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 APPP05067 770 aa26.91■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 ADCYAP1R1P41586 468 aa26.91■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 Q7L0L9 218 aa26.91■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 MKL1Q969V6 931 aa26.91■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa26.91■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 CLIP2Q9UDT6 1046 aa26.91■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 PLIN4Q96Q06 1357 aa26.9■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP2A1O14983 1001 aa26.9■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 IFNL3Q8IZI9 196 aa26.9■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC17A8Q8NDX2 589 aa26.9■■□□□ 1.9
TRDMT1-211ENST00000495022 MTMR4Q9NYA4 1195 aa26.9■■□□□ 1.9
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