RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		20.55	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	20.55	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		20.55	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	MSC	O60682	206 aa		20.54	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	PEX10	O60683	326 aa		20.54	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	FDX1	P10109	184 aa		20.54	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	PPARA	Q07869	468 aa		20.54	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	20.54	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		20.54	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		20.54	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		20.54	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		20.54	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	CEP290	O15078	2479 aa		20.54	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	ZMYM6	O95789	1325 aa		20.53	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424		F5H6K3	240 aa		20.53	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP2A1	O14983	1001 aa		20.53	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	TTLL1	O95922	423 aa		20.53	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	FGR	P09769	529 aa		20.53	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	KLRC3	Q07444	240 aa		20.53	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		20.53	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		20.53	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		20.53	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	20.53	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		20.53	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		20.52	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	VWA5A	O00534	786 aa		20.52	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	20.52	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	ERCC3	P19447	782 aa		20.52	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	20.52	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP2B2	Q01814	1243 aa		20.52	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		20.52	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		20.52	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	ATG4C	Q96DT6	458 aa		20.52	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		20.52	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	20.52	■□□□□ 0.88
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPY3	P0CV98	308 aa		20.51	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPY8	P0CW00	308 aa		20.51	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	20.51	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	DPP9	Q86TI2	863 aa		20.51	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	NBPF3	Q9H094	633 aa		20.51	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		20.51	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	20.51	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	20.51	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXP2	O15409	715 aa		20.5	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	ORC4	O43929	436 aa		20.5	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	PLA2G6	O60733	806 aa		20.5	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	FCER1A	P12319	257 aa		20.5	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	ADORA2A	P29274	412 aa		20.5	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	STAT3	P40763	770 aa		20.5	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM32	Q13049	653 aa		20.5	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		20.5	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR78	Q5VTH9	848 aa		20.5	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	DPF3	Q92784	378 aa		20.5	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		20.5	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		20.5	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	FEM1B	Q9UK73	627 aa		20.5	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	HIP1	O00291	1037 aa		20.49	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	NOV	P48745	357 aa		20.49	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	OAZ1	P54368	228 aa		20.49	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	CCL14	Q16627	93 aa		20.49	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		20.49	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	LHX8	Q68G74	356 aa		20.49	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	REPS2	Q8NFH8	660 aa		20.49	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	RILPL2	Q969X0	211 aa		20.49	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	CEP95	Q96GE4	821 aa		20.49	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	20.49	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	RLF	Q13129	1914 aa		20.49	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0G2JMZ2	1700 aa		20.48	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFB10	O96000	172 aa		20.48	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	TFAP4	Q01664	338 aa		20.48	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		20.48	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	GMCL1	Q96IK5	515 aa		20.48	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	20.48	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		20.48	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		20.48	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	ALPK3	Q96L96	1907 aa		20.47	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	PRDM1	O75626	825 aa		20.47	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	20.47	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	PLS1	Q14651	629 aa		20.47	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	20.47	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		20.47	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		20.47	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424		H0YGN5	161 aa		20.46	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBED4	O75132	1171 aa		20.46	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	FGA	P02671	866 aa		20.46	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	20.46	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	20.46	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		20.46	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		20.46	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		20.46	■□□□□ 0.87
HDAC10-216	ENST00000489424	EVI5	O60447	810 aa		20.45	■□□□□ 0.86
HDAC10-216	ENST00000489424	COBL	O75128	1261 aa		20.45	■□□□□ 0.86
HDAC10-216	ENST00000489424	COL6A1	P12109	1028 aa		20.45	■□□□□ 0.86
HDAC10-216	ENST00000489424	CYBA	P13498	195 aa		20.45	■□□□□ 0.86
HDAC10-216	ENST00000489424	SDS	P20132	328 aa		20.45	■□□□□ 0.86
HDAC10-216	ENST00000489424	KCTD2	Q14681	263 aa		20.45	■□□□□ 0.86
HDAC10-216	ENST00000489424	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		20.45	■□□□□ 0.86
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM160B2	Q86V87	743 aa		20.45	■□□□□ 0.86
HDAC10-216	ENST00000489424	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		20.45	■□□□□ 0.86
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		20.45	■□□□□ 0.86

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms