RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 CAPN15O75808 1086 aa14.31□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 MCCP23508 829 aa14.31□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 FCGRTP55899 365 aa14.31□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 PRKCZQ05513 592 aa14.31□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 LBX2Q6XYB7 198 aa14.31□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.31□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.31□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 A0A0G2JMZ2 1700 aa14.31□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 PLXNB2O15031 1838 aa14.31□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 SLC27A2O14975 620 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 NECTIN1Q15223 517 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 CHST3Q7LGC8 479 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 SRRDQ9UH36 339 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 BMP3P12645 472 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 TTBK2Q6IQ55 1244 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 KCTD1Q719H9 257 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 KRT23Q9C075 422 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 MYPNQ86TC9 1320 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 TMEM232C9JQI7 657 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 VWA5AO00534 786 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 TNKSO95271 1327 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 SLC1A4P43007 532 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 FLT3LGP49771 235 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 SNAP25P60880 206 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 PLS1Q14651 629 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 ARHGEF6Q15052 776 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 CASC1Q6TDU7 716 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 REPS2Q8NFH8 660 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 KIFC2Q96AC6 838 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 GMCL1Q96IK5 515 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 TTC14Q96N46 770 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 SENP2Q9HC62 589 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 GJD2Q9UKL4 321 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
NISCH-210ENST00000488157 GNRH1P01148 92 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 ANTXR2P58335 489 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 SEC23AQ15436 765 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 WDR78Q5VTH9 848 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 GPR142Q7Z601 462 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 IQCA1Q86XH1 822 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 DGKHQ86XP1 1220 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 RASEFQ8IZ41 740 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 COA7Q96BR5 231 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 GPCPD1Q9NPB8 672 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 PDHBP11177 359 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 ELNP15502 786 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 HOXD10P28358 340 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 SLC16A2P36021 539 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 TRDNQ13061 729 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 CCDC96Q2M329 555 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 NCOA7Q8NI08 942 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 RAET1EQ8TD07 263 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 ANKS1AQ92625 1134 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 FEM1BQ9UK73 627 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 GOLGA8HP0CJ92 632 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 ERCC3P19447 782 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 MAPK4P31152 587 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 SLC4A3P48751 1232 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 CPXCR1Q8N123 301 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 MB21D1Q8N884 522 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 PNMA1Q8ND90 353 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 CPVLQ9H3G5 476 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 RIPK3Q9Y572 518 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 ADCY3O60266 1144 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 SNHG28P0DPA3 235 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-210ENST00000488157 CYP2B6P20813 491 aa14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms