RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480476.1

NIN-211, Transcript of ninein, humanhuman

TSL 3

Gene NIN, Length 920 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIN-211ENST00000480476 CYFIP1Q7L576 1253 aa5.69□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 UBXN4Q92575 508 aa5.69□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 SPON2Q9BUD6 331 aa5.69□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 FOXQ1Q9C009 403 aa5.69□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 WNT10AQ9GZT5 417 aa5.69□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 PARD6AQ9NPB6 346 aa5.69□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 NCOA2Q15596 1464 aa5.69□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 FGD6Q6ZV73 1430 aa5.68□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa5.68□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 MED14OSP0DP75 135 aa5.68□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 CAP2P40123 477 aa5.68□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 GJA8P48165 433 aa5.68□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 ARID5AQ03989 594 aa5.68□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 TTBK2Q6IQ55 1244 aa5.68□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 VPS37DQ86XT2 251 aa5.68□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 KIAA0825Q8IV33 1275 aa5.68□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 MFSD2AQ8NA29 543 aa5.68□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 GPRASP2Q96D09 838 aa5.68□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 PLPPR2Q96GM1 343 aa5.68□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 GMLQ99445 158 aa5.68□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa5.68□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 TLR6Q9Y2C9 796 aa5.68□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 ATP10BO94823 1461 aa5.68□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa5.68□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa5.68□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 CLSPNQ9HAW4 1339 aa5.68□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 CHD1O14646 1710 aa5.68□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 SHROOM2Q13796 1616 aa5.67□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 SLITRK5O94991 958 aa5.67□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 ATP2B1P20020 1258 aa5.67□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 ETF1P62495 437 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 RPS26P62854 115 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP5.67□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 SFRP5Q5T4F7 317 aa5.67□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 C22orf34Q6ZV56 151 aa5.67□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 HID1Q8IV36 788 aa5.67□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 PHC3Q8NDX5 983 aa5.67□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 RHOVQ96L33 236 aa5.67□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa5.67□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 PRDM7Q9NQW5 492 aa5.67□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 CTNND2Q9UQB3 1225 aa5.67□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 ABCA8O94911 1581 aa5.67□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 PHLDB1Q86UU1 1377 aa5.67□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 PF4P02776 101 aa5.66□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 LMNB1P20700 586 aa5.66□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 FBXL19Q6PCT2 694 aa5.66□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 AGMOQ6ZNB7 445 aa5.66□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 RASGRP4Q8TDF6 673 aa5.66□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 GAL3ST3Q96A11 431 aa5.66□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 MIPEPQ99797 713 aa5.66□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 FBRSQ9HAH7 460 aa5.66□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa5.66□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 KDM5BQ9UGL1 1544 aa5.65□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 TCAF2A6NFQ2 919 aa5.65□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 GARTP22102 1010 aa5.65□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 LMNB2Q03252 620 aa5.65□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 FAM160A1Q05DH4 1040 aa5.65□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 SNAP47Q5SQN1 464 aa5.65□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 MFSD4AQ8N468 514 aa5.65□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 KCNQ5Q9NR82 932 aa5.65□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 TACC3Q9Y6A5 838 aa5.65□□□□□ -1.5
NIN-211ENST00000480476 KIF14Q15058 1648 aa5.65□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 SETD5Q9C0A6 1442 aa5.65□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 WDR7Q9Y4E6 1490 aa5.64□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 CFAP43Q8NDM7 1665 aa5.64□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 NUAK1O60285 661 aa5.64□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 GREM1O60565 184 aa5.64□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 CST3P01034 146 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 GLDCP23378 1020 aa5.64□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 NKG7Q16617 165 aa5.64□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 TMEM67Q5HYA8 995 aa5.64□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 LETMD1Q6P1Q0 360 aa5.64□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 MCF2L2Q86YR7 1114 aa5.64□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 GOLM1Q8NBJ4 401 aa5.64□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 KIRREL1Q96J84 757 aa5.64□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 COX4I2Q96KJ9 171 aa5.64□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 SPATA32Q96LK8 384 aa5.64□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 HSPA12BQ96MM6 686 aa5.64□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 NT5C1AQ9BXI3 368 aa5.64□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 SEMA3GQ9NS98 782 aa5.64□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 ROCK1Q13464 1354 aa5.64□□□□□ -1.51
NIN-211ENST00000480476 PRR33A8MZF0 331 aa5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms