RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474147.5

RBMS1-208, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 2

Gene RBMS1, Length 2,854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-208	ENST00000474147	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	TEX9	Q8N6V9	391 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	ARL10	Q8N8L6	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	P3H4	Q92791	437 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	AGAP3	Q96P47	875 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	PREB	Q9HCU5	417 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	CLIC4	Q9Y696	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	LRRD1	A4D1F6	860 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	FYB1	O15117	783 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	CREB3	O43889	395 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	CTDNEP1	O95476	244 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	PFKFB1	P16118	471 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	NAT1	P18440	290 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	ERVK-24	P63145	666 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	C2orf54	Q08AI8	447 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	PNOC	Q13519	176 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	G2E3	Q7L622	706 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	ERICH1	Q86X53	443 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	CAVIN3	Q969G5	261 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	IFT43	Q96FT9	208 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	MED15	Q96RN5	788 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	RUFY1	Q96T51	708 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147		A0A1B0GTH6	734 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	TMEM221	A6NGB7	291 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	KIF3B	O15066	747 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF185	O15231	689 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	EVI5	O60447	810 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	MFAP3L	O75121	409 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	MBD4	O95243	580 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	CYP11B2	P19099	503 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	CCND1	P24385	295 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	PBX1	P40424	430 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	EPHB4	P54760	987 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147		Q4G0T1	1027 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	EMB	Q6PCB8	327 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	C17orf50	Q8WW18	174 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147		A0A1W2PP64	1363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	SMAP	O00193	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ABLIM1	O14639	778 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	BACH1	O14867	736 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	SASH1	O94885	1247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	CMA1	P23946	247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	PSMC4	P43686	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	GJA8	P48165	433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	LONRF3	Q496Y0	759 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	CD302	Q8IX05	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	MLKL	Q8NB16	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	PHC3	Q8NDX5	983 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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