RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470268.1

SF3B1-208, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, human

TSL 2

Gene SF3B1, Length 2,003 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SF3B1-208	ENST00000470268	MAP2K3	P46734	347 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	5.76	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	PI16	Q6UXB8	463 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	GGA1	Q9UJY5	639 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	USP3	Q9Y6I4	520 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268		A0A1B0GUL6	1792 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	NFKBIE	O00221	500 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	SLC5A1	P13866	664 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	NPR3	P17342	541 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	MX2	P20592	715 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	NOS2	P35228	1153 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	MCAM	P43121	646 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	PRELP	P51888	382 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	SERTM1	A2A2V5	107 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	EML1	O00423	815 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	5.75	□□□□□ -1.49	1e-11	■■■□□ 15.3
SF3B1-208	ENST00000470268	ATP5J	P18859	108 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	KCNJ4	P48050	445 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	RASGRF1	Q13972	1273 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	CCDC93	Q567U6	631 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	XP32	Q5T750	250 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	TTC22	Q5TAA0	569 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	C16orf46	Q6P387	395 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	MYO19	Q96H55	970 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	COL4A5	P29400	1685 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	MED23	Q9ULK4	1368 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268		H3BRB1	525 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	GPR25	O00155	361 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	OIP5	O43482	229 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	CHGB	P05060	677 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	ECM1	Q16610	540 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	GORAB	Q5T7V8	394 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	CACNA1S	Q13698	1873 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	AOX1	Q06278	1338 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	PROC	P04070	461 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	SDS	P20132	328 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	ZAP70	P43403	619 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	POU4F2	Q12837	409 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	AOC3	Q16853	763 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	PSMD1	Q99460	953 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	HAUS7	Q99871	368 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	CD209	Q9NNX6	404 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	PHF24	Q9UPV7	400 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	JAG2	Q9Y219	1238 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	YDJC	A8MPS7	323 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	ERC2	O15083	957 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	FAM13A	O94988	1023 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	F11	P03951	625 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	ITGB2	P05107	769 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	IL1R1	P14778	569 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	ERCC3	P19447	782 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SF3B1-208	ENST00000470268	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		5.73	□□□□□ -1.49

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