RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465634.5

TRIM5-208, Transcript of tripartite motif containing 5, human

TSL 1 (best)

Gene TRIM5, Length 602 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM5-208	ENST00000465634	RTN1	Q16799	776 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	FAM160B2	Q86V87	743 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	MICU3	Q86XE3	530 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	HSCB	Q8IWL3	235 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	TMX3	Q96JJ7	454 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	FEM1B	Q9UK73	627 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	USP17L15	C9J2P7	530 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	USP17L11	C9JVI0	530 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	KLRF2	D3W0D1	207 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	USP17L18	D6R9N7	530 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	USP17L22	D6RA61	530 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	USP17L19	D6RCP7	530 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	USP17L20	D6RJB6	530 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	RAD21	O60216	631 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	CDKL5	O76039	1030 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	FDX1	P10109	184 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	VCAM1	P19320	739 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	STAT2	P52630	851 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	USP17L24	Q0WX57	530 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	NOG	Q13253	232 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	CCDC96	Q2M329	555 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	GTF3C6	Q969F1	213 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	MYL10	Q9BUA6	226 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	MYPN	Q86TC9	1320 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	OTOF	Q9HC10	1997 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	CPLX1	O14810	134 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	C1QTNF8	P60827	252 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	SREBF2	Q12772	1141 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	MOGS	Q13724	837 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	COG2	Q14746	738 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	TMEM232	C9JQI7	657 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	HSPA6	P17066	643 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	IFNAR1	P17181	557 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	RXRA	P19793	462 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	OSBP	P22059	807 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	CDC27	P30260	824 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	MAP2K2	P36507	400 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	TM4SF4	P48230	202 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	SCRN1	Q12765	414 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	STK3	Q13188	491 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	CUL4A	Q13619	759 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	NTRK3	Q16288	839 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	CCL15	Q16663	113 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	KCTD1	Q719H9	257 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	PNMA3	Q9UL41	463 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	PNMA2	Q9UL42	364 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	MTMR7	Q9Y216	660 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TRIM5-208	ENST00000465634	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TRIM5-208	ENST00000465634	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TRIM5-208	ENST00000465634	FLOT1	O75955	427 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TRIM5-208	ENST00000465634	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TRIM5-208	ENST00000465634	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TRIM5-208	ENST00000465634	FUT2	Q10981	343 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TRIM5-208	ENST00000465634	TRAF1	Q13077	416 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TRIM5-208	ENST00000465634	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TRIM5-208	ENST00000465634	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		11.2	□□□□□ -0.62

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