RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HAND2P61296 217 aa13.27□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ERVK-9P63128 1117 aa13.27□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ERVK-24P63145 666 aa13.27□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DGKHQ86XP1 1220 aa13.27□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 USP6NLQ92738 828 aa13.27□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LAMA4Q16363 1823 aa13.27□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A0G2JMZ2 1700 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ATP2A1O14983 1001 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NECTIN1Q15223 517 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC178Q5BJE1 867 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPICE1Q8N0Z3 855 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SHCBP1Q8NEM2 672 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 REPS2Q8NFH8 660 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PXYLP1Q8TE99 480 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ESR2Q92731 530 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRT23Q9C075 422 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CNNM2Q9H8M5 875 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BTBD7Q9P203 1132 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZSWIM5Q9P217 1185 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa13.26□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MGAMO43451 1857 aa13.25□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PARP14Q460N5 1801 aa13.25□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NEDD4P46934 1319 aa13.25□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NMT2O60551 498 aa13.25□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGHA2P01877 340 aa13.25□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SNHG28P0DPA3 235 aa13.25□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FDX1P10109 184 aa13.25□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TOP1P11387 765 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MAPK4P31152 587 aa13.25□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCNA1P78396 465 aa13.25□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa13.25□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DOCK3Q8IZD9 2030 aa13.25□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 VWA5AO00534 786 aa13.24□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDC45O75419 566 aa13.24□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FLOT1O75955 427 aa13.24□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RGS19P49795 217 aa13.24□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ATP2B2Q01814 1243 aa13.24□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MORN1Q5T089 497 aa13.24□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM83BQ5T0W9 1011 aa13.24□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLFN13Q68D06 897 aa13.24□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BTNL9Q6UXG8 535 aa13.24□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP13.24□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COA7Q96BR5 231 aa13.24□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM47Q9BQJ4 181 aa13.24□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MTA3Q9BTC8 594 aa13.24□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TANGO6Q9C0B7 1094 aa13.24□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PORCNQ9H237 461 aa13.24□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FBXO28Q9NVF7 368 aa13.24□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FEM1BQ9UK73 627 aa13.24□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 STX8Q9UNK0 236 aa13.24□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SSUH2Q9Y2M2 353 aa13.24□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa13.24□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYH4Q9Y623 1939 aa13.23□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 STRNO43815 780 aa13.23□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PEX10O60683 326 aa13.23□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KDM4AO75164 1064 aa13.23□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HOXC6P09630 235 aa13.23□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BMP3P12645 472 aa13.23□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FLT3LGP49771 235 aa13.23□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRKCZQ05513 592 aa13.23□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM132BQ14DG7 1078 aa13.23□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TSGA10IPQ3SY00 556 aa13.23□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ATG4CQ96DT6 458 aa13.23□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF333Q96JL9 665 aa13.23□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLF1Q9BQI6 1058 aa13.23□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPATC1LQ9H0A9 340 aa13.23□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GABRQQ9UN88 632 aa13.23□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 B4E1Z4 1266 aa13.22□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OAZ1P54368 228 aa13.22□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SEC23AQ15436 765 aa13.22□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa13.22□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 STOX1Q6ZVD7 989 aa13.22□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GPR142Q7Z601 462 aa13.22□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLEKHH3Q7Z736 793 aa13.22□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IQCA1Q86XH1 822 aa13.22□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RIOX2Q8IUF8 465 aa13.22□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ABRAQ8N0Z2 381 aa13.22□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CHURC1Q8WUH1 139 aa13.22□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DCAF4Q8WV16 495 aa13.22□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KCNB2Q92953 911 aa13.22□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MROH8Q9H579 483 aa13.22□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa13.22□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TAF6LQ9Y6J9 622 aa13.22□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLXNB2O15031 1838 aa13.22□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC15A5A6NIM6 579 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 E7EWF7 191 aa13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.3 ms